Вы можете обрезать bookID
, чтобы он соответствовал вашему параметру.
String deleteString = "DELETE FROM booksFavourite WHERE userID=? AND trim(both '\"' from bookID)=?;";
или
Вы можете concat
"
на вашемпараметр для сопоставления в вашем bookID
String deleteString = "DELETE FROM booksFavourite WHERE userID=? AND bookID=concat('\"', ?, '\"');";