Изменить ggsurvplot (font.size) и тип доверительных интервалов - PullRequest
Новая
       58

Изменить ggsurvplot (font.size) и тип доверительных интервалов

0 голосов
/ 06 февраля 2020

Я пытаюсь изменить и лучше понять, как работает функция ggsurvplot() (пакет: survminer):

Прежде всего, некоторый код: 


suppressPackageStartupMessages(library(survival))
suppressPackageStartupMessages(library(survminer))
suppressPackageStartupMessages(library(tidyverse))

set.seed(2020)

exp <- sample_n(lung, size = 10, replace = F) %>%
  select(time, status)

exp <- sample_n(lung, size = 10, replace = F) %>%
  select(time, status)

exp$survival <- Surv(exp$time, exp$status == 2)

exp_fit <- survfit(survival ~ 1, data = exp, conf.type = "log-log")

ggsurvplot(exp_fit,
           data = exp,
           palette = "black",
           censor.shape = "I",
           censor.size = 5.5,
           xlab = "days",
           ylab = "survival probability",
           conf.int = T,
           surv.scale = "percent",
           legend.title = "censored data",
           legend.lab = "",
           legend ="bottom")

Фрейм данных используется называется lung. Данные содержатся в пакете survival.

В основном у меня два вопроса:

  1. На графике печатаются доверительные интервалы, как и должно быть, НО какой тип? Являются ли они такими же, как я указал в функции survfit(), которую я использовал для создания объекта exp_fit, и если нет, то что нужно изменить, чтобы использовать тот же тип доверительных интервалов?

  2. Размер шрифта легенды довольно маленький. Как я могу сделать это больше? Я пытался работать с theme(), но, к сожалению, это не сработало.

Буду признателен за ваши ответы. Заранее спасибо.

...