Я пытался ie запустить gwasvcf_to_TwoSampleMR функцию из пакета R gwasglue на моем примере и обнаружил следующую ошибку:
Error in (function (classes, fdef, mtable) :
unable to find an inherited method for function ‘header’ for signature ‘"character"’
Я попытался запустить анализ MR с MDD результата , Мой набор данных был получен с веб-сайта PG C: "https://www.med.unc.edu/pgc/results-and-downloads/mdd/ PG C". Имя файла: «MDD No UKB / No 23andMe», а формат файла - VCF.
Я попытался удалить информационные строки (строки с 1 по 58) в файле VCF, но это не помогло решить проблему. Я также попытался удалить символ "#" из строки заголовка; Однако это также не сработало.
Поэтому мне было интересно, каковы возможные причины этой проблемы?
Спасибо,
Цзы-Тин