Дискретизировать все растры в стеке в R - PullRequest
Новая
       60

Дискретизировать все растры в стеке в R

0 голосов
/ 11 марта 2020

Я пытаюсь одновременно дискретизировать 5 растровых растров в R в квартильные значения. Я написал следующее l oop для этого, но, похоже, он работает неправильно. В коде «stack.dis c» - это стек, а «квартили» - это фрейм данных из 5 столбцов с 5 растрами в качестве столбцов и значениями их квартилей, перечисленными в строках. 

for(i in 1:ncol(quartiles)) {
  for(j in 1:length(stack.disc@layers[[i]])) {
    if(isTRUE(stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] >= quartiles[1,i] &
                stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] < quartiles[2,i])) {
        stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] = 1 
    }
    if(isTRUE(stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] >= quartiles[2,i] &
                stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] < quartiles[3,i])) {
        stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] = 2
    }
    if(isTRUE(stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] >= quartiles[3,i] &
                stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] < quartiles[4,i])) {
        stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] = 3
    }
    if(isTRUE(stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] >= quartiles[4,i] &
                stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] <= quartiles[5,i])) {
        stack.disc@layers[[i]]@data@values[j] = 4
    }
  }
}

код работает, но только на первых 3 растрах в стеке. Есть идеи, почему это не работает в течение последних 2?

Спасибо!

1 Ответ

1 голос
/ 11 марта 2020

Вы можете использовать cut для переклассификации растров (у него есть метод растров *). 

s2 = stack(lapply(names(stack.disc), function(n) 
                  cut(stack.disc[[n]], breaks=quartiles[,n])))

Или, более короткая версия, используя stackApply

stackApply(stack.disc, 1:5, function(r, na.rm) cut(r, breaks=quartiles[,names(r)]))

Некоторые воспроизводимые данные для демонстрации: 

stack.disc = stack(lapply(1:5, function(i) raster(matrix(rnorm(25, i),5,5))))
quartiles = t(quantile(stack.disc))
#         layer.1  layer.2  layer.3  layer.4  layer.5
# 0%   -1.0937068 0.498138 1.142862 2.229032 3.078026
# 25%   0.5171343 1.799564 2.496730 3.108751 4.484395
# 50%   1.1293477 2.099162 2.896269 3.818627 4.939167
# 75%   1.6348539 2.481976 3.615938 4.693733 5.314098
# 100%  2.4405652 3.511051 4.886970 5.456095 6.929452
...