R: Как измерить разницу с категориями и цифрами c - PullRequest
1 голос
/ 11 марта 2020

Я очень плохо знаком с обработкой данных. И теперь у меня есть эта проблема под рукой:

Так что в основном я использовал таблицы биохимических измерений (все численные) пациентов для выполнения кластерного анализа, и таким образом я отсортировал их по 5 кластерам.

Тогда у меня также есть свои клинические данные / особенности, теперь я хочу спросить, значительно ли отличаются эти клинические признаки (сочетание числовых и категориальных признаков) от одного кластера к другому. Так как я могу go об этом? Какой тест я должен выполнить? Есть ли хорошая библиотека, на которую я должен смотреть?

Чтобы дать вам представление о «клинических данных»:

ClusterAssigned  PatientID  age sex stage FISH      IGHV        IgG ...
      1          S134567    50  m   4     11q       mutated     scig
      1          S234667    80  m   2     13q       mutated     6.5
      1          S135677    55  f   4     11q       na          scig
      1          S356576    94  f   2     13q,t12   unmutated   5
      1          S187978    59  m   4     11q       mutated     scig
      4          S278967    80  f   2     17q       unmutated   6.5
      4          S123467    75  f   4     na        unmutated   9.1
      4          S234577    62  m   2     t12       mutated     9
  .....

Итак, вы видите, что назначенный кластер основан на моем кластерном анализе , FI SH, IGHV, IgG являются категориальными, и вы можете видеть, что иногда есть значения n, а иногда один человек может иметь несколько записей "13q, t12".

В дисконтированном виде я, возможно, просто могу взять пациенты кластера 1 и 4 выбрасывают всех на и спрашивают, есть ли разница в их возрасте, поле, FI SH, IGHV ... Тем не менее, какой метод я могу использовать здесь, чтобы выполнить такой тест в одном * 1016? *

1 Ответ

0 голосов
/ 11 марта 2020

Вы можете сначала преобразовать категориальные переменные в фиктивные переменные, а затем выполнить обычный кластерный анализ.

Все становится сложнее, если вы заказали категориальные поля

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...