У меня это было в TortoiseSVN, и ошибка была связана с новым каталогом, который я создал в новом проекте. Я только что создал этот проект, поэтому этот каталог никогда не существовал. Я посмотрел в браузере хранилища, и новая папка действительно уже была в хранилище, но TortoiseSVN не показывал ее как зафиксированную.
Чтобы обойти это, так как я все равно только что создал папку, я удалил ее в хранилище, а затем сделал коммит. Работало нормально.
Поскольку я делал это вне Visual Studio, мне пришлось перезапустить Visual Studio, чтобы он снова все выяснил.