Невозможно построить графики спектра мощности с помощью пакета MNE - PullRequest
Новая
       71

Невозможно построить графики спектра мощности с помощью пакета MNE

0 голосов
/ 31 января 2020

Я пытаюсь проанализировать данные ЭЭГ с устройства Emotiv Epoc + и не могу построить графики спектра мощности, используя функцию plot_psd ().

Исходный набор данных выглядит следующим образом:

Исходные данные ЭЭГ в формате CSV

, где AF3, F7, F3, FC5, T7, P7 , ... являются значениями от электродов устройства. Я поднастроил данные, содержащие информацию о четырнадцати электродах, создал информационную структуру, необходимую MNE, и, наконец, необработанный объект.

Информация необработанного объекта следующая:

Объект выборки данных имеет 918475 временных выборок и 14 каналов. Последняя выборка времени находится на 7175,578125 секундах. Первые несколько имен каналов: AF3, F7, F3. 

bad channels: []
128.0 Hz
None 

    <Info | 16 non-empty fields
        bads : list | 0 items
        ch_names : list |  AF3,  F7,  F3,  FC5,  T7,  P7,  O1,  O2,  P8, ...
        chs : list | 14 items (MISC: 14)
        comps : list | 0 items
        custom_ref_applied : bool | False
        dev_head_t : Transform | 3 items
        events : list | 0 items
        highpass : float | 0.0 Hz
        hpi_meas : list | 0 items
        hpi_results : list | 0 items
        lowpass : float | 64.0 Hz
        meas_date : NoneType | unspecified
        nchan : int | 14
        proc_history : list | 0 items
        projs : list | 0 items
        sfreq : float | 128.0 Hz
        acq_pars : NoneType
        acq_stim : NoneType
        ctf_head_t : NoneType
        description : NoneType
        dev_ctf_t : NoneType
        device_info : NoneType
        dig : NoneType
        experimenter : NoneType
        file_id : NoneType
        gantry_angle : NoneType
        helium_info : NoneType
        hpi_subsystem : NoneType
        kit_system_id : NoneType
        line_freq : NoneType
        meas_id : NoneType
        proj_id : NoneType
        proj_name : NoneType
        subject_info : NoneType
        utc_offset : NoneType
        xplotter_layout : NoneType

Когда я использую команду для построения графика спектра мощности 

raw.plot_psd(fmax = 50)

Я получаю следующую ошибку:

---> 3 raw.plot_psd (fmax = 50) 

<C:\Users\ey417\Anaconda3\lib\site-packages\mne\externals\decorator.py:decorator-gen-147> in plot_psd(self, fmin, fmax, tmin, tmax, proj, n_fft, n_overlap, reject_by_annotation, picks, ax, color, xscale, area_mode, area_alpha, dB, estimate, show, n_jobs, average, line_alpha, spatial_colors, verbose)

~\Anaconda3\lib\site-packages\mne\utils\_logging.py in wrapper(*args, **kwargs)
     88             with use_log_level(verbose_level):
     89                 return function(*args, **kwargs)
---> 90         return function(*args, **kwargs)
     91     return FunctionMaker.create(
     92         function, 'return decfunc(%(signature)s)',

~\Anaconda3\lib\site-packages\mne\io\base.py in plot_psd(self, fmin, fmax, tmin, tmax, proj, n_fft, n_overlap, reject_by_annotation, picks, ax, color, xscale, area_mode, area_alpha, dB, estimate, show, n_jobs, average, line_alpha, spatial_colors, verbose)
   1583                             dB=dB, estimate=estimate, show=show, n_jobs=n_jobs,
   1584                             average=average, line_alpha=line_alpha,
-> 1585                             spatial_colors=spatial_colors, verbose=verbose)
   1586 
   1587     @copy_function_doc_to_method_doc(plot_raw_psd_topo)

<C:\Users\ey417\Anaconda3\lib\site-packages\mne\externals\decorator.py:decorator-gen-133> in plot_raw_psd(raw, fmin, fmax, tmin, tmax, proj, n_fft, n_overlap, reject_by_annotation, picks, ax, color, xscale, area_mode, area_alpha, dB, estimate, show, n_jobs, average, line_alpha, spatial_colors, verbose)

~\Anaconda3\lib\site-packages\mne\utils\_logging.py in wrapper(*args, **kwargs)
     88             with use_log_level(verbose_level):
     89                 return function(*args, **kwargs)
---> 90         return function(*args, **kwargs)
     91     return FunctionMaker.create(
     92         function, 'return decfunc(%(signature)s)',

~\Anaconda3\lib\site-packages\mne\viz\raw.py in plot_raw_psd(raw, fmin, fmax, tmin, tmax, proj, n_fft, n_overlap, reject_by_annotation, picks, ax, color, xscale, area_mode, area_alpha, dB, estimate, show, n_jobs, average, line_alpha, spatial_colors, verbose)
    618     fig, picks_list, titles_list, units_list, scalings_list, ax_list, \
    619         make_label = _set_psd_plot_params(
--> 620             raw.info, proj, picks, ax, area_mode)
    621     del ax
    622     psd_list = list()

~\Anaconda3\lib\site-packages\mne\viz\utils.py in _set_psd_plot_params(info, proj, picks, ax, area_mode)
   2959     _data_types = ('mag', 'grad', 'eeg', 'seeg', 'ecog')
   2960     _check_option('area_mode', area_mode, [None, 'std', 'range'])
-> 2961     picks = _picks_to_idx(info, picks)
   2962 
   2963     # XXX this could be refactored more with e.g., plot_evoked

~\Anaconda3\lib\site-packages\mne\io\pick.py in _picks_to_idx(info, picks, none, exclude, allow_empty, with_ref_meg, return_kind)
    930     if picks.dtype.char in ('S', 'U'):
    931         picks = _picks_str_to_idx(info, picks, exclude, with_ref_meg,
--> 932                                   return_kind, orig_repr, allow_empty)
    933         if return_kind:
    934             picked_ch_type_or_generic = picks[1]

~\Anaconda3\lib\site-packages\mne\io\pick.py in _picks_str_to_idx(info, picks, exclude, with_ref_meg, return_kind, orig_repr, allow_empty)
    984                     not allow_empty:
    985                 raise ValueError('picks (%s) yielded no channels, consider '
--> 986                                  'passing picks explicitly' % (orig_repr,))
    987 
    988     #

ValueError: picks (None, treated as "data") yielded no channels, consider passing picks explicitly
...