Ошибка при использовании MNE: ValueError: Массив не должен содержать Infs или NaNs - PullRequest
Новая
       67

Ошибка при использовании MNE: ValueError: Массив не должен содержать Infs или NaNs

0 голосов
/ 20 марта 2020

Кажется, у меня проблема с зависимостью mne-python следующим образом: 

RuntimeWarning: invalid value encountered in greater
  mask = (size > 0)
Traceback (most recent call last):
  File "/Users/opt/anaconda3/envs/mytfenv/lib/python3.7/site-packages/IPython/core/interactiveshell.py", line 3319, in run_code
    exec(code_obj, self.user_global_ns, self.user_ns)
  File "<ipython-input-4-997c912b5fa5>", line 23, in <module>
    prep_pipeline.fit()
  File "/Users/Documents/preprocessing/prep_pipeline.py", line 80, in fit
    reference.perform_reference()
  File "/Users/Documents/preprocessing/reference.py", line 66, in perform_reference
    self.robust_reference()
  File "/Users/Documents/preprocessing/reference.py", line 144, in robust_reference
    noisy_detector.find_all_bad_channels(ransac=self.ransac)
  File "/Users/Documents/preprocessing/find_noisy_channels.py", line 140, in find_all_bad_channels
    self.find_bad_by_ransac()
  File "/Users/Documents/preprocessing/find_noisy_channels.py", line 476, in find_bad_by_ransac
    n_samples=n_samples,
  File "/Users/Documents/preprocessing/find_noisy_channels.py", line 581, in run_ransac
    chn_pos, chn_pos_good, good_chn_labs, n_pred_predicted, data
  File "/Users/Documents/preprocessing/find_noisy_channels.py", line 632, in get_ransac_pred
    interpol_mat = _make_interpolation_matrix(reconstructed_positions, chn_pos)
  File "/Users/opt/anaconda3/envs/mytfenv/lib/python3.7/site-packages/mne/channels/interpolation.py", line 85, in _make_interpolation_matrix
    C_inv = linalg.pinv(C)
  File "/Users/opt/anaconda3/envs/mytfenv/lib/python3.7/site-packages/scipy/linalg/basic.py", line 1304, in pinv
    a = _asarray_validated(a, check_finite=check_finite)
  File "/Users/opt/anaconda3/envs/mytfenv/lib/python3.7/site-packages/scipy/_lib/_util.py", line 246, in _asarray_validated
    a = toarray(a)
  File "/Users/opt/anaconda3/envs/mytfenv/lib/python3.7/site-packages/numpy/lib/function_base.py", line 499, in asarray_chkfinite
    "array must not contain infs or NaNs")
ValueError: array must not contain infs or NaNs

Я понимаю, что ValueError: array must not contain infs or NaNs означает, что в моем массиве есть некоторые нечисловые значения. Однако, когда я проверяю, есть ли в моем массиве значения NaNs или infs, используя этот ответ , я получаю False в качестве результата (то есть infs или NaNs нет ). Кто-нибудь знает, почему это может иметь место?

...