Не нужно предполагать. В документации Image # разница отмечается, что метод разности вызывает API-интерфейс ImageMagick IsImagesEqual.
Нет единого метода RMagick, который соответствует команде сравнения ImageMagick. Команда сравнения вызывает десятки различных API-интерфейсов ImageMagick в зависимости от параметров команды. Вообще говоря, RMagick отображает каждый из этих API в качестве метода.