$('#container').clone().attr('id', 'container2').find('select > option').each(function() {
var $elem = $(this);
var value = $elem.val();
alert(value);
});
Изменен селектор в методе поиска для выбора> опции из выбора.
Также, почему вы клонируете элемент, если не собираетесь добавлять его в DOM.
Чтобы получить выбранное значение клонированного элемента, вы можете использовать
$('#container').clone().attr('id', 'container2').find('select > option:selected').val()
Если вам нужно вставить клонированный элемент в DOM, вы можете использовать
$('#container').clone().attr('id', 'container2').appendTo("body")
и полный код для получения значения выбранного параметра после вставки клонированного элемента в DOM
$('#container').clone().attr('id', 'container2').appendTo("body").find('select > option:selected').val()
Полный код для нажатия кнопки
$(document).ready(function(){
$('#test').click(function(){
$('#container').clone().attr('id', 'container2').appendTo("body").find('select > option:selected').each(function() {
alert ( $(this).val());
});
});
});