Я пытаюсь использовать read_tsv() для загрузки своих данных в R следующим образом:
dat <- read_tsv("output.txt")
Ранее я использовал ту же функцию для текстовых файлов, разделенных табуляцией, и она работала просто отлично. Однако на этот раз я получаю следующую ошибку:
Parsed with column specification:
cols(
col_logical(),
`_1` = col_logical(),
`_2` = col_logical(),
`_3` = col_logical(),
`_4` = col_logical(),
`_5` = col_logical(),
`_6` = col_logical(),
`_7` = col_logical(),
`_8` = col_logical(),
`_9` = col_logical(),
`_10` = col_logical(),
`_11` = col_logical()
)
Warning: 448 parsing failures.
row col expected actual file
1 1/0/T/F/TRUE/FALSE 'deneme.txt'
1 -- 12 columns 1 columns 'deneme.txt'
2 1/0/T/F/TRUE/FALSE 'deneme.txt'
2 _1 1/0/T/F/TRUE/FALSE 'deneme.txt'
2 _2 1/0/T/F/TRUE/FALSE 'deneme.txt'
... ... .................. ......... ............
See problems(...) for more details.
Warning message:
Duplicated column names deduplicated: '' => '_1' [2], '' => '_2' [3], '' => '_3' [4], '' => '_4' [5], '' => '_5' [6], '' => '_6' [7], '' => '_7' [8], '' => '_8' [9], '' => '_9' [10], '' => '_10' [11], '' => '_11' [12]
Что, очевидно, не работает, но не работает странным образом, я не понимаю. Он думает, что есть 11 столбцов, а их 12. Затем он не может угадать правильный тип данных (ни один из них не является логическим), что он мог успешно раньше! Я включил пример набора данных, который работал с read_tsv() раньше, и пример набора данных, который сейчас не работает.
Это пример данных, которые не работали:
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 adam 1 1 239.85434301424775 --undefined-- 247.7376112047195 235.3560147034298 52.05022323524527 6.5499112757148295 55.65949698112956 0.08126228269085413
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 adam 1 2 244.8835520848779 1.4564070245792597 246.82072176997366 243.70359367821465 64.89187579458462 2.1641176020019386 66.88747347027808
0.08126228269085413
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 adam 1 3 261.5729831605207 41.85930844916797 307.1142693228187 204.36913741336025 64.89187579458462 1.2151362742415437 61.957796034834814
0.08126228269085413
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 i 2 1 166.22560617807903 --undefined-- 204.36913741336025 151.99560810090307 63.11853517394699 --undefined-- 63.54749436042272 0.2603628117913832
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 i 2 2 151.5917235900652 --undefined-- 151.99560810090307 151.1878390792273 63.78952447455676 --undefined-- 63.8658531351568 0.2603628117913832
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 i 2 3 194.42181693674587 --undefined-- 241.71658370470496 133.73542865220801 63.78952447455676 --undefined-- 64.20475934014964 0.2603628117913832
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 aldat 3 1 262.8748473239633 25.96753914339153 307.20648672837325 238.5251389434482 66.66386883205 1.4649381878481265 68.28592866615767 0.41604686318972034
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 aldat 3 2 240.1288558709347 4.340209556654576 244.20543055789503 235.79454784524034 58.28521765232964 5.75233546883736 62.85806413243511
0.41604686318972034
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 aldat 3 3 243.40106390906058 2.0057544696869543 244.93290262696132 241.07738646120566 58.28521765232964 11.47909682502898 62.307285139208574
0.41604686318972034
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 ti 4 1 --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined-- 35.761099547455565 1.0017991871649559 35.200858427407184 0.7000302343159486
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 ti 4 2 --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined-- 43.39233384796458 2.461654789948961 44.797095277535874 0.7000302343159486
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 ti 4 3 --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined-- 43.39233384796458 1.5866872677343318 42.0051005461374 0.7000302343159486
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 kadin 5 1 225.2816396620663 --undefined-- 225.92521370361135 222.91796772766446 47.58943608188635 6.558659128476658 53.23731630459665 0.8870294784580498
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 kadin 5 2 213.50307273189148 9.815765419804642 222.91796772766446 195.3915292510744 48.803239148178186 6.2908212606955916 54.46476384096549
0.8870294784580498
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 kadin 5 3 194.48213136593407 0.7021069213634096 195.3915292510744 193.97185882759527 48.803239148178186 0.8647268899860352 46.46325708290779
0.8870294784580498
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 aslan 1 1 185.06203630746313 3.0069371384674346 187.99581838427886 181.98692793330403 52.22509773118971 5.3966524703478 56.09242035734275
0.1256084656084656
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 aslan 1 2 200.04479355019342 --undefined-- 200.04479355019342 200.04479355019342 43.79895997909392 4.207566032378694 46.61999480251702
0.1256084656084656
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 aslan 1 3 204.8645621866751 5.164766914157635 212.83049249499618 200.04479355019342 43.79895997909392 1.8605349885564046 52.344312104474156
0.1256084656084656
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 i 2 1 213.22057211800305 --undefined-- 213.61065174100995 212.83049249499618 47.014841486812955 --undefined-- 46.36188846231947 0.38925170068027215
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 i 2 2 214.00073136401681 --undefined-- 214.39081098702368 213.61065174100995 45.312184769532934 --undefined-- 46.25970753246626 0.38925170068027215
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 i 2 3 215.28052779011452 --undefined-- 216.17390493884704 214.39081098702368 45.312184769532934 --undefined-- 43.26751661234397 0.38925170068027215
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 farket 3 1 203.4524841321715 13.02287342953739 217.9883871067541 191.76848637183997 48.075301545190676 7.678678001355539 52.961210239177575
0.562857142857143
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 farket 3 2 191.54198199571675 0.6629050380820111 192.2667554528704 190.6990271670027 49.94781556089073 9.344765523013207 54.70386015525213
0.562857142857143
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 farket 3 3 166.67471907673996 2.7120805688608813 169.2595643602701 163.85118175698642 49.94781556089073 12.00717880033682 50.014609942160256
0.562857142857143
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 ti 4 1 --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined-- 19.953680817791607 0.5673981502076435 20.277130388296754 0.8903099017384732
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 ti 4 2 --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined-- 24.042946776686932 2.565586747107994 25.848757636861166 0.8903099017384732
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 ti 4 3 --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined-- 24.042946776686932 1.9264697112352631 31.2719825242349 0.8903099017384732
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 zebra 5 1 161.7417580823549 2.079841825255008 163.27478185517484 157.88807315194387 41.92516442972372 5.809893957726305 47.23632116085485
1.0846182917611489
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 zebra 5 2 152.21416609249926 2.970678492911428 157.88807315194387 150.31651324857864 41.56347538469716 6.965679368576994 44.8215467918196
1.0846182917611489
ovsm1_aslani_farketti_zebra_2a_09 zebra 5 3 75.52172005509577 0.08920499095075367 75.58479750911273 75.45864260107881 41.56347538469716 4.551521119599394 41.90632850358233
1.0846182917611489
ovsm1_baskani_kurtardi_bakan_2c_01 baskan 1 1 240.76895527350814 1.5696547946572375 242.503316946734 239.44591440988654 56.403026798058214 2.23519960665316 58.5770781416923
0.11944066515495087
ovsm1_baskani_kurtardi_bakan_2c_01 baskan 1 2 258.61023079686254 --undefined-- 258.7950547842763 257.8006696215377 50.082422888701785 3.9480395401208708 52.60495753461821
0.11944066515495087
ovsm1_baskani_kurtardi_bakan_2c_01 baskan 1 3 251.2679829640712 4.14451945597683 257.8006696215377 246.40835145753346 50.082422888701785 1.7915834521264493 62.28480855329315
0.11944066515495087
И это пример данных, которые read_tsv() успешно загружены без проблем вообще:
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 9 0.4 0.45 --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined--
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 10 0.45 0.5 --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined--
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 11 0.5 0.55 --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined--
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 12 0.55 0.6000000000000001 --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined-- --undefined--
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 13 0.6000000000000001 0.6500000000000001 233.86893970704796 233.86893970704799 233.86893970704799 --undefined-- --undefined--
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 14 0.65 0.7000000000000001 234.24005566263858 233.86893970704799 234.85594376542952 0.5595983208963401 0.3956957674464077
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 15 0.7000000000000001 0.7500000000000001 235.9879740218075 234.85594376542952 241.32094897195597 4.176501029868071 2.953232199852312
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 16 0.75 0.8 244.75133379179994 241.32094897195594 247.30132784643698 3.556196511848743 2.5146106687601923
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 17 0.8 0.8500000000000001 245.49460060262726 243.6665144874841 250.39140474206968 3.7390266816142006 2.6438911216068353
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 18 0.8500000000000001 0.9000000000000001 264.48847476991347 250.39140474206968 288.1600613822647 19.401877001123214 13.71919879524154
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 19 0.9 0.9500000000000001 301.9497823905812 288.1600613822647 304.6781451710905 10.767522125987322 7.6137879118618255
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 20 0.9500000000000001 1 294.00877104330345 281.75464754519567 302.23539630709365 --undefined-- --undefined--
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 21 1 1.05 267.1116914771332 252.4266779707776 281.75464754519567 14.597373365551347 10.321901694293253
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 22 1.05 1.1 242.68837776772395 237.53600386597762 252.4266779707776 --undefined-- --undefined--
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 23 1.1 1.1500000000000001 236.84062256860992 234.55206240291247 241.12565737547783 3.7347359713544623 2.640857131286068
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 24 1.1500000000000001 1.2000000000000002 244.14092895237954 241.12565737547783 246.51029185839977 3.2868834353701843 2.3241775661199924
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 25 1.2000000000000002 1.2500000000000002 244.42961650562458 243.78693176718346 245.14105774643633 0.9219975654378295 0.6519507307585768
ovsm1_adami_aldatti_kadin_2a_05 26 1.25 1.3 243.4631249982616 243.2572947348176 244.11500512007814 --undefined-- --undefined--
Я не вижу разницы между двумя наборами данных, они оба разделены табуляцией. Почему read_tsv() работает для одного, а не для другого?