Если график создается из кадра данных
library(igraph)
df<-data.frame(from=c(1,2,3), to=c(1,2,3), time=c(1,2,3))
g<-graph_from_data_frame(df,directed=TRUE,vertices=NULL)
как добавить к нему ребра, используя второй кадр данных
df1<-data.frame(from=c(1,2,3), to=c(2,3,1), time=c(4,5,6))