Я новичок, пытающийся использовать NanoStrigDiff или лимму для вычисления дифференциальной экспрессии гена. У меня есть эксперименты a и b, а также контроль a и b. У меня есть набор данных Nanostring для каждой группы, и я хотел бы создать матричную таблицу. Вот что я хотел бы сравнить. expa/cona:expa/cona.
Мне удалось создать группы в объекте data.frame:
> levels (group)
[1] "cona" "conb" "expa" "expb"
Я не уверен, как создать модель.matrix здесь.
Любая помощь оценил.
Спасибо