Ошибка в консенсусной карте функции NMF пакета R: match_atrack - неверный трек аннотации - PullRequest
0 голосов
/ 28 февраля 2020

Я пытаюсь создать несколько тепловых карт с помощью функции consensusmap пакета NMF:

consensusmap(estim.rank, annCol=NMF.matrix.var1000, labCol=NA, labRow=NA)

Я получаю следующую ошибку:

Ошибка в match_atrack (объект, данные): match_atrack - Неверная дорожка аннотации [71.1215703392946, 128.773146296147, ..., 1058300.82024376]: больше элементов [1000], чем строк в данных [23]. Вызовы: consensusmap ... sapply -> lapply -> FUN -> FUN -> .local -> match_atrack

Кто-то сообщил об этой ошибке здесь https://github.com/renozao/NMF/issues/33, но решение было изменить пакетный stringr к более старой версии, моя первоначальная версия была 1.4.0, я перешел на версию 0.6 и получил ошибку, сообщающую, что для пакета NMF требуется версия stringr> 1.0.0. Затем я перешел на версию 1.1.0 и получил ту же ошибку (Ошибка в match_atrack).

Есть предложения?

Спасибо

...