RMark, результат анализа грызунов и повторного поимки = ноль - PullRequest
0 голосов
/ 04 февраля 2020

Я использую RMark для определения численности грызунов по четырем типам растительности. У меня было 26 сайтов с 2 ночами ловушек на каждом сайте. Каждая ночь состояла из 50 ловушек, поэтому 100 ночей ловушки за очко. У меня было всего 3 повторных поимки. Возможно ли провести какой-либо анализ для определения вероятности и численности на разных участках? Когда я попытался запустить модель для «закрытой популяции», на выходе было нулевое значение. Я ценю любые комментарии или рекомендации. Спасибо!

> str(rodentmark2)
'data.frame':   66 obs. of  7 variables:
 $ Site     : Factor w/ 14 levels "A","B","C","E",..: 1 1 1 2 3 3 3 3 4 4 ...
 $ Date     : Factor w/ 24 levels "10/12/2019","10/13/2019",..: 12 13 13 14 15 15 16 16 17 17 ...
 $ animal_id: int  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
 $ ch       : chr  "10" "01" "01" "10" ...
 $ night_1  : int  1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 ...
 $ night_2  : int  0 1 1 0 0 0 1 1 0 0 ...
 $ detect   : int  1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...


> head(rodentmark2)
  Site      Date animal_id ch night_1 night_2 detect
1    A 5/21/2019         1 10       1       0      1
2    A 5/22/2019         2 01       0       1      1
3    A 5/22/2019         3 01       0       1      1
4    B 5/25/2019         4 10       1       0      1
5    C 5/29/2019         5 10       1       0      1
6    C 5/29/2019         6 10       1       0      1


> dput(rodentmark2)
structure(list(Site = structure(c(1L, 1L, 1L, 2L, 3L, 3L, 3L, 
3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 
5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 6L, 7L, 8L, 8L, 9L, 9L, 9L, 9L, 9L, 9L, 
10L, 10L, 10L, 10L, 10L, 10L, 10L, 11L, 11L, 12L, 12L, 12L, 13L, 
13L, 14L, 14L, 14L, 14L, 14L, 14L, 14L, 14L, 14L, 14L, 14L, 14L, 
14L), .Label = c("A", "B", "C", "E", "F", "K", "O", "Q", "R", 
"T", "V", "X", "Y", "Z"), class = "factor"), Date = structure(c(12L, 
13L, 13L, 14L, 15L, 15L, 16L, 16L, 17L, 17L, 17L, 17L, 18L, 18L, 
18L, 19L, 19L, 19L, 19L, 19L, 20L, 20L, 20L, 20L, 20L, 20L, 20L, 
20L, 20L, 21L, 22L, 23L, 24L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 3L, 3L, 
3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 5L, 5L, 6L, 7L, 7L, 8L, 9L, 10L, 10L, 10L, 
10L, 10L, 10L, 11L, 11L, 11L, 11L, 11L, 11L, 11L), .Label = c("10/12/2019", 
"10/13/2019", "10/20/2019", "10/21/2019", "11/13/2019", "11/22/2019", 
"11/23/2019", "11/25/2019", "11/26/2019", "12/2/2019", "12/3/2019", 
"5/21/2019", "5/22/2019", "5/25/2019", "5/29/2019", "5/30/2019", 
"6/3/2019", "6/4/2019", "6/6/2019", "6/7/2019", "8/15/2019", 
"9/10/2019", "9/24/2019", "9/25/2019"), class = "factor"), animal_id = 1:66, 
    ch = c("10", "01", "01", "10", "10", "10", "01", "01", "10", 
    "10", "10", "10", "01", "01", "01", "10", "10", "10", "10", 
    "10", "01", "01", "01", "01", "01", "01", "01", "01", "01", 
    "10", "10", "10", "01", "10", "10", "11", "01", "01", "01", 
    "10", "11", "10", "01", "01", "01", "01", "10", "10", "11", 
    "01", "01", "10", "01", "10", "10", "10", "10", "10", "10", 
    "01", "01", "01", "01", "01", "01", "01"), night_1 = c(1L, 
    0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 1L, 
    1L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 
    1L, 0L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
    1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 0L), night_2 = c(0L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 
    1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 
    1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 
    1L, 1L, 1L, 0L, 1L, 0L, 1L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 
    0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L
    ), detect = c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
    1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
    1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
    1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
    1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L)), row.names = c(NA, 
-66L), class = "data.frame")

rodentmark2$dht$individuals$summary

rodentmark2$dht$Site$summary
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...