Пакет RADami: создание класса объектов 'phylog' - PullRequest
0 голосов
/ 04 февраля 2020

У меня есть phylogeneti c дерево "m20.mlbtbs" с классом "phylo", которое я должен преобразовать в класс "phylog", чтобы иметь возможность строить графики. Я попытался использовать функцию as.phylo, однако я получаю ошибку аргумента 'length'

# read tree
 treedata <- read.tree("m20.mlbtbs")

 class(treedata)

 [1] "phylo"

 # creating phylog file
 (treephylog  <-  as.phylo(treedata, 'phylog'))

при выполнении, функция запрашивает у меня какое-то целое число, которое я не знаю!

1:

2:

затем, когда я пропускаю это, нажимая ввод, я получаю эту ошибку Error in numeric(dim(tr$edge)[1]) : invalid 'length' argument

Я не знаю, что указать в качестве аргумента длины, в документации нет объяснений, по крайней мере, в моем понимании! какие-либо идеи просьбы?

...