Преобразование изображения опубликованной филогении в формат Newick в R - PullRequest
1 голос
/ 13 февраля 2020

Мне нужно использовать опубликованную филогению для последующего анализа, и для этого я должен преобразовать дерево из изображения в формате pdf, jpg или tiff в машиночитаемый формат newick. В настоящее время я использую функцию locator для измерения длины отдельных ветвей в изображении, вдохновленном этой записью , и создаю формат newick вручную. Хотя это работает, процесс является дорогостоящим и подвержен ошибкам.

Существует ли более удобный и надежный способ использования опубликованной филогении для дальнейших исследований? Я не ищу варианты пересчета филогении по данным последовательности ДНК.

...