Сервер ноутбука jupyter не работает с версией jupyter из активной среды conda - PullRequest
0 голосов
/ 13 января 2020

Я пытаюсь запустить сервер ноутбуков jupyter, используя jupyter v5 или выше, чтобы исправить эту проблему с Bokeh .

У меня установлена ​​anaconda с окружением (называемым " py36 "), и оба which python и which jupyter указывают на расположение этой среды в этой установке conda.

В ноутбуке jupyter я могу выбрать из базового ядра python или моего py36 conda kernel.

Однако , сам сервер jupyter не работает, используя версию из моего списка conda. conda list показывает, что jupyter может быть запущен с использованием версии 5.7.2, но когда я открываю jupyter и нажимаю help -> about, он показывает, что работает только версия 4.0.0:

The version of the notebook server is 4.2.0 and is running on:
Python 3.5.1 (default, Apr 29 2016, 10:11:48) 
[GCC 4.8.3 20140911 (Red Hat 4.8.3-9)]

Current Kernel Information:
Python 3.6.6 |Anaconda, Inc.| (default, Oct  9 2018, 12:34:16) 
Type 'copyright', 'credits' or 'license' for more information
IPython 7.1.1 -- An enhanced Interactive Python. Type '?' for help.

Я хочу Сам сервер будет работать с использованием показанного ядра anaconda.

Я следовал за другими ответами на stackoverflow, но они фокусируются на среде. В результате я установил ipykernel, nb_conda и nb_conda_kernels, но никто из них не исправил это. Я также пытался создать новое ядро ​​с помощью python -m ipykernel install --user --name other-env --display-name "Python (other-env)".

Как мне запустить сервер jupyter с версией 5.7.2, которую я установил в моей среде conda?

Вывод из conda list:

    # packages in environment at /home/tnichol/anaconda3/envs/py36:
#
# Name                    Version                   Build  Channel
_anaconda_depends         2019.03                  py36_0  
_libgcc_mutex             0.1                        main  
alabaster                 0.7.12                   py36_0  
anaconda                  custom                   py36_1  
anaconda-client           1.7.2                    py36_0  
anaconda-project          0.8.2                    py36_0  
animatplot                0.4.0.dev1                dev_0    <develop>
appdirs                   1.4.3            py36h28b3542_0  
asn1crypto                0.24.0                   py36_0  
astroid                   2.0.4                    py36_0  
astropy                   3.2.1            py36h7b6447c_0  
atomicwrites              1.2.1                    py36_0  
attrs                     18.2.0           py36h28b3542_0  
automat                   0.7.0                    py36_0  
babel                     2.6.0                    py36_0  
backcall                  0.1.0                    py36_0  
backports                 1.0                      py36_1  
backports.os              0.1.1                    py36_0  
backports.shutil_get_terminal_size 1.0.0                    py36_2  
beautifulsoup4            4.6.3                    py36_0  
bitarray                  0.8.3            py36h14c3975_0  
bkcharts                  0.2                      py36_0  
blas                      1.0                         mkl  
blaze                     0.11.3                   py36_0  
bleach                    3.0.2                    py36_0  
blosc                     1.14.4               hdbcaa40_0  
bokeh                     1.2.0                    py36_0  
boto                      2.49.0                   py36_0  
bottleneck                1.2.1            py36h035aef0_1  
bzip2                     1.0.6                h14c3975_5  
ca-certificates           2019.11.27                    0  
cairo                     1.14.12              h8948797_3  
certifi                   2019.11.28               py36_0  
cffi                      1.11.5           py36he75722e_1  
cftime                    1.0.3.4          py36hdd07704_1  
chardet                   3.0.4                    py36_1  
click                     7.0                      py36_0  
cloudpickle               0.6.1                    py36_0  
clyent                    1.2.2                    py36_1  
colorama                  0.4.0                    py36_0  
constantly                15.1.0           py36h28b3542_0  
contextlib2               0.5.5                    py36_0  
cryptography              2.3.1            py36hc365091_0  
curl                      7.55.1               h78862de_4  
cycler                    0.10.0                   py36_0  
cython                    0.29             py36he6710b0_0  
cytoolz                   0.9.0.1          py36h14c3975_1  
dask                      2.1.0                    pypi_0    pypi
dask-core                 2.1.0                      py_0  
datashape                 0.5.4                    py36_1  
dbus                      1.13.2               h714fa37_1  
decorator                 4.3.0                    py36_0  
defusedxml                0.5.0                    py36_1  
distributed               2.1.0                      py_0  
docutils                  0.14                     py36_0  
entrypoints               0.2.3                    py36_2  
et_xmlfile                1.0.1                    py36_0  
expat                     2.2.6                he6710b0_0  
fastcache                 1.0.2            py36h14c3975_2  
filelock                  3.0.10                   py36_0  
flask                     1.0.2                    py36_1  
flask-cors                3.0.7                    py36_0  
fontconfig                2.13.0               h9420a91_0  
freetype                  2.9.1                h8a8886c_1  
fribidi                   1.0.5                h7b6447c_0  
get_terminal_size         1.0.0                haa9412d_0  
gevent                    1.3.7            py36h7b6447c_1  
glib                      2.56.2               hd408876_0  
glob2                     0.6                      py36_1  
gmp                       6.1.2                h6c8ec71_1  
gmpy2                     2.0.8            py36h10f8cd9_2  
graphite2                 1.3.12               h23475e2_2  
greenlet                  0.4.15           py36h7b6447c_0  
gst-plugins-base          1.14.0               hbbd80ab_1  
gstreamer                 1.14.0               hb453b48_1  
h5py                      2.8.0            py36h989c5e5_3  
harfbuzz                  1.8.8                hffaf4a1_0  
hdf4                      4.2.13               h3ca952b_2  
hdf5                      1.10.2               hba1933b_1  
heapdict                  1.0.0                    py36_2  
html5lib                  1.0.1                    py36_0  
hyperlink                 18.0.0                   py36_0  
icu                       58.2                 h9c2bf20_1  
idna                      2.7                      py36_0  
imageio                   2.5.0                    py36_0  
imagesize                 1.1.0                    py36_0  
importlib_metadata        0.6                      py36_0  
incremental               17.5.0                   py36_0  
intel-openmp              2019.4                      243  
ipykernel                 5.1.1            py36h39e3cac_0  
ipython                   7.1.1            py36h39e3cac_0  
ipython_genutils          0.2.0                    py36_0  
ipywidgets                7.4.2                    py36_0  
isort                     4.3.4                    py36_0  
itsdangerous              1.1.0                    py36_0  
jbig                      2.1                  hdba287a_0  
jdcal                     1.4                      py36_0  
jedi                      0.13.1                   py36_0  
jeepney                   0.4                      py36_0  
jinja2                    2.10                     py36_0  
joblib                    0.13.2                   py36_0  
jpeg                      9b                   h024ee3a_2  
jsonschema                2.6.0                    py36_0  
jupyter                   1.0.0                    py36_7  
jupyter_client            5.2.3                    py36_0  
jupyter_console           6.0.0                    py36_0  
jupyter_core              4.4.0                    py36_0  
jupyterlab                0.35.3                   py36_0  
jupyterlab_launcher       0.13.1                   py36_0  
jupyterlab_server         0.2.0                    py36_0  
keyring                   16.1.0                   py36_0  
kiwisolver                1.0.1            py36hf484d3e_0  
krb5                      1.16.1               hc83ff2d_6  
lazy-object-proxy         1.3.1            py36h14c3975_2  
libcurl                   7.61.1               heec0ca6_0  
libedit                   3.1.20170329         h6b74fdf_2  
libffi                    3.2.1                hd88cf55_4  
libgcc-ng                 8.2.0                hdf63c60_1  
libgfortran-ng            7.3.0                hdf63c60_0  
libnetcdf                 4.6.1                h10edf3e_2  
libpng                    1.6.37               hbc83047_0  
libsodium                 1.0.16               h1bed415_0  
libssh2                   1.8.0                h9cfc8f7_4  
libstdcxx-ng              9.1.0                hdf63c60_0  
libtiff                   4.0.9                he85c1e1_2  
libtool                   2.4.6                h7b6447c_5  
libuuid                   1.0.3                h1bed415_2  
libxcb                    1.13                 h1bed415_1  
libxml2                   2.9.8                h26e45fe_1  
libxslt                   1.1.32               h1312cb7_0  
llvmlite                  0.29.0           py36hd408876_0  
locket                    0.2.0                    py36_1  
lxml                      4.2.5            py36hefd8a0e_0  
lzo                       2.10                 h49e0be7_2  
markupsafe                1.1.0            py36h7b6447c_0  
matplotlib                3.1.0            py36h5429711_0  
mccabe                    0.6.1                    py36_1  
mistune                   0.8.4            py36h7b6447c_0  
mkl                       2019.4                      243  
mkl-service               2.0.2            py36h7b6447c_0  
mkl_fft                   1.0.12           py36ha843d7b_0  
mkl_random                1.0.2            py36hd81dba3_0  
more-itertools            4.3.0                    py36_0  
mpc                       1.1.0                h10f8cd9_1  
mpfr                      4.0.1                hdf1c602_3  
mpmath                    1.0.0                    py36_2  
msgpack-python            0.5.6            py36h6bb024c_1  
multipledispatch          0.6.0                    py36_0  
natsort                   5.5.0                    pypi_0    pypi
nb_conda                  2.2.1                    py36_0  
nb_conda_kernels          2.2.2                    py36_0  
nbconvert                 5.3.1                    py36_0  
nbformat                  4.4.0                    py36_0  
ncurses                   6.1                  he6710b0_1  
netcdf4                   1.4.2            py36h4b4f87f_0  
networkx                  2.2                      py36_1  
nltk                      3.3.0                    py36_0  
nose                      1.3.7                    py36_2  
notebook                  5.7.2                    py36_0  
numba                     0.44.1           py36h962f231_0  
numexpr                   2.6.9            py36h9e4a6bb_0  
numpy                     1.16.4           py36h7e9f1db_0  
numpy-base                1.16.4           py36hde5b4d6_0  
numpydoc                  0.8.0                    py36_0  
odo                       0.5.1                    py36_0  
olefile                   0.46                     py36_0  
openpyxl                  2.5.9                    py36_0  
openssl                   1.0.2u               h7b6447c_0  
packaging                 18.0                     py36_0  
pandas                    0.24.2           py36he6710b0_0  
pandoc                    2.2.3.2                       0  
pandocfilters             1.4.2                    py36_1  
pango                     1.42.4               h049681c_0  
parso                     0.3.1                    py36_0  
partd                     1.0.0                      py_0  
patchelf                  0.9                  he6710b0_3  
path.py                   11.5.0                   py36_0  
pathlib2                  2.3.2                    py36_0  
patsy                     0.5.1                    py36_0  
pcre                      8.42                 h439df22_0  
pep8                      1.7.1                    py36_0  
pexpect                   4.6.0                    py36_0  
pickleshare               0.7.5                    py36_0  
pillow                    5.3.0            py36h34e0f95_0  
pip                       18.1                     py36_0  
pixman                    0.34.0               hceecf20_3  
pkginfo                   1.4.2                    py36_1  
pluggy                    0.8.0                    py36_0  
ply                       3.11                     py36_0  
prometheus_client         0.4.2                    py36_0  
prompt_toolkit            2.0.7                    py36_0  
psutil                    5.4.8            py36h7b6447c_0  
ptyprocess                0.6.0                    py36_0  
py                        1.7.0                    py36_0  
pyasn1                    0.4.4            py36h28b3542_0  
pyasn1-modules            0.2.2                    py36_0  
pycodestyle               2.4.0                    py36_0  
pycosat                   0.6.3            py36h14c3975_0  
pycparser                 2.19                     py36_0  
pycrypto                  2.6.1            py36h14c3975_9  
pycurl                    7.43.0.2         py36hb7f436b_0  
pyflakes                  2.0.0                    py36_0  
pygments                  2.2.0                    py36_0  
pyhamcrest                1.9.0                    py36_2  
pylint                    2.1.1                    py36_0  
pyodbc                    4.0.24           py36he6710b0_0  
pyopenssl                 18.0.0                   py36_0  
pyparsing                 2.3.0                    py36_0  
pyqt                      5.9.2            py36h05f1152_2  
pyrsistent                0.14.11          py36h7b6447c_0  
pysocks                   1.6.8                    py36_0  
pytables                  3.4.4            py36ha205bf6_0  
pytest                    4.0.0                    py36_0  
pytest-arraydiff          0.3              py36h39e3cac_0  
pytest-astropy            0.5.0                    py36_0  
pytest-doctestplus        0.2.0                    py36_0  
pytest-openfiles          0.3.2                    py36_0  
pytest-remotedata         0.3.1                    py36_0  
python                    3.6.6                h6e4f718_2  
python-dateutil           2.7.5                    py36_0  
pytz                      2018.7                   py36_0  
pywavelets                1.0.3            py36hdd07704_1  
pyyaml                    3.13             py36h14c3975_0  
pyzmq                     17.1.2           py36h14c3975_0  
qt                        5.9.6                h8703b6f_2  
qtawesome                 0.5.3                    py36_0  
qtconsole                 4.4.2                    py36_0  
qtpy                      1.5.2                    py36_0  
readline                  7.0                  h7b6447c_5  
requests                  2.20.1                   py36_0  
rise                      5.4.1                 py36_1000    conda-forge
rope                      0.11.0                   py36_0  
ruamel_yaml               0.15.46          py36h14c3975_0  
scikit-image              0.15.0           py36he6710b0_0  
scikit-learn              0.21.2           py36hd81dba3_0  
scipy                     1.3.0            py36h7c811a0_0  
seaborn                   0.9.0                    py36_0  
secretstorage             3.1.0                    py36_0  
send2trash                1.5.0                    py36_0  
service_identity          17.0.0           py36h28b3542_0  
setuptools                40.6.2                   py36_0  
simplegeneric             0.8.1                    py36_2  
singledispatch            3.4.0.3                  py36_0  
sip                       4.19.8           py36hf484d3e_0  
six                       1.11.0                   py36_1  
snappy                    1.1.7                hbae5bb6_3  
snowballstemmer           1.2.1                    py36_0  
sortedcollections         1.0.1                    py36_0  
sortedcontainers          2.0.5                    py36_0  
soupsieve                 1.8                      py36_0  
sphinx                    1.8.2                    py36_0  
sphinxcontrib             1.0                      py36_1  
sphinxcontrib-websupport  1.1.0                    py36_1  
spyder                    3.3.2                    py36_0  
spyder-kernels            0.3.0                    py36_0  
sqlalchemy                1.2.14           py36h7b6447c_0  
sqlite                    3.25.3               h7b6447c_0  
statsmodels               0.10.0           py36hdd07704_0  
sympy                     1.3                      py36_0  
tblib                     1.3.2                    py36_0  
terminado                 0.8.1                    py36_1  
testpath                  0.4.2                    py36_0  
tk                        8.6.8                hbc83047_0  
toolz                     0.9.0                    py36_0  
tornado                   5.1.1            py36h7b6447c_0  
tqdm                      4.28.1           py36h28b3542_0  
traitlets                 4.3.2                    py36_0  
twisted                   18.9.0           py36h7b6447c_0  
typed-ast                 1.1.0            py36h14c3975_0  
unicodecsv                0.14.1                   py36_0  
unixodbc                  2.3.7                h14c3975_0  
urllib3                   1.23                     py36_0  
wcwidth                   0.1.7                    py36_0  
webencodings              0.5.1                    py36_1  
werkzeug                  0.14.1                   py36_0  
wheel                     0.32.3                   py36_0  
widgetsnbextension        3.4.2                    py36_0  
wrapt                     1.10.11          py36h14c3975_2  
wurlitzer                 1.0.2                    py36_0  
xarray                    0.14.1+37.gdb36c5c           dev_0    <develop>
xlrd                      1.1.0                    py36_1  
xlsxwriter                1.1.2                    py36_0  
xlwt                      1.3.0                    py36_0  
xrft                      0.1                       dev_0    <develop>
xstorm                    0.1                       dev_0    <develop>
xz                        5.2.4                h14c3975_4  
yaml                      0.1.7                had09818_2  
zeromq                    4.2.5                hf484d3e_1  
zict                      0.1.3                    py36_0  
zipp                      0.5.1                      py_0  
zlib                      1.2.11               h7b6447c_3  
zope                      1.0                      py36_1  
zope.interface            4.6.0            py36h7b6447c_0  
zstd                      1.3.7                h0b5b093_0

...