Я не думаю, что пакет rouge это позволяет, но вы можете просто отформатировать вывод:
formatted_scores = [{key: {k: "{0:.2f}".format(v) for k, v in value.items()} for key, value in s.items()} for s in scores]
print(formatted_scores)
[{'rouge-1': {'f': '0.67', ' p ':' 0.67 ',' r ':' 0.67 '},' rouge-2 ': {' f ':' 0.50 ',' p ':' 0.50 ',' r ':' 0.50 '},' rouge -l ': {' f ':' 0.67 ',' p ':' 0.67 ',' r ':' 0.67 '}}]