Я пытаюсь прочитать файл ml c (вывод из программы CODEML), используя read.codeml_mlc function из пакета treeio, следующим образом:
library(ggtree)
library(treeio)
tree <- read.codeml_mlc(mlc_file)
Однако я получаю следующая ошибка:
Ошибка в strsplit (., split = "[[: space:]]"): не символьный аргумент
Кто-нибудь имеет представление о том, что может быть не так? Это обычный вывод ml c из PAML из модели ветвления со свободным отношением, я не изменял и не изменял его. Однако, похоже, ошибка связана с моим файлом, потому что я попытался запустить пример из учебника (чтение файла ml c, поставляемого с пакетом), и он отлично работает.
Поместите его в другое путь: Откуда возникает функция strsplit при чтении файла ml c и к какой именно части файла она относится? Возможно, зная, что это поможет решить мою проблему.
Заранее спасибо за любую помощь, которая может быть оказана !!