У меня есть система python и R, а также anaconda, и они, похоже, не конфликтуют, и у меня та же ОС, что и у вас. Conda, менеджер пакетов и среды, поставляемый с anaconda, предположительно не очень хорошо сочетается с pip, что означает, что если у вас есть виртуальная среда, вы должны использовать одну или другую. Однако я смешал их без каких-либо трудностей.
Я предпочитаю создавать виртуальные среды более стандартным способом, но есть некоторые научные пакеты c, которые намного проще установить с помощью conda.