Если у вас есть N изображений размером 100 X 100, вы должны передать массив с размером (N, 100, 100). Функция разбивается по первому измерению. Таким образом, если вы передаете один массив размером 100x100, он думает, что каждая строка вашего изображения является тренировочным шаблоном, и сохраняет 3/4 изображения в качестве обучающего набора.