вы можете изменить это на лету -
найти сервисный монитор (на пользовательском интерфейсе Prometheus это цель) как -
kubectl get servicemonitor -n <NAMESPACE>
.
k get servicemonitor -n <NAMESPACE> <SERVICEMONITOR_NAME> -o yaml | sed 's/interval: [0-9][0-9]s/interval: 50s/' | kubectl replace -f -
Для автоматической перезагрузки оператор прометея имеет конфигуратор-перегрузчик, вы можете установить его как контейнер рядом с вашим прометеем.