У меня есть относительное изобилие в качестве объекта phyloseq. Может ли кто-нибудь предложить, как я могу построить биплот (CCA ИЛИ RDA), показывающий тип texa со стрелкой после этого шага, используя vegan или ggbiplot?
physeq <- phyloseq(OTU, TAX, samples)
colnames(tax_table(physeq))= c("Kingdom","Phylum","Class","Order","Family","Genus", "Species")
rank_names(physeq)
nsamples(physeq)
ntaxa(physeq)
physeq2Phylum=tax_glom(physeq,"Phylum",NArm=TRUE)
physeq2PhylumR = transform_sample_counts(physeq2Phylum, function(x) x / sum(x))
Большое спасибо