Проблема с настройкой wd - PullRequest
Новая
       16

Проблема с настройкой wd

0 голосов
/ 20 января 2020

Привет всем, у кого возникли проблемы с выполнением этого кода. Вот что сказал мне мой босс, решив такую ​​проблему. PLease advice. 

require(data.table)
require(MASS)

dat = fread("~/OneDrive - SUNY Upstate Medical University/bin/projects/rdoc/brett_project_igt/WGCNA_moduleEigengenes_SamplePhenotype.txt")
#working on setting the right directory
#C:\Users\brett\OneDrive\Desktop\Lab\brett_project_igt
dat = fread("~/Users/brett/OneDrive/Desktop/Lab/WGCNA_moduleEigengenes_SamplePhenotype.txt")

hist(dat$IGT_total_net)
hist(dat$IGT_total_lat)

# linear model
fit = lm(IGT_total_net  ~ Age + Gender + SV1 + race + RIN + ME36, data = dat)
summary(fit)

# negative binomial model
fit = glm.nb(IGT_total_lat ~ Age + Gender + SV1 + race + RIN + ME36, data = dat)
summary(fit)

Вот мое самое последнее сообщение об ошибке, некоторые из предыдущих проблем не имели правильного wd, а также проблемы с функцией fread. Заранее спасибо. 

Error in fread("C:/Users/brett/AppData/Local/Packages/Microsoft.MicrosoftEdge_8wekyb3d8bbwe/TempState/Downloads") : 
  File 'C:/Users/brett/AppData/Local/Packages/Microsoft.MicrosoftEdge_8wekyb3d8bbwe/TempState/Downloads' is a directory. Not yet implemented.
...