Вы можете использовать CWnd :: MoveWindow:
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/5bc5w1zz%28VS.80%29.aspx
Если ваш GroupBox находится, например, в диалоге и имеет контрольный идентификатор IDC_MYGROUP, то вы можете вызвать любой метод / обработчик события диалога
GetDlgItem(IDC_MYGROUP)->MoveWindow(NewX,NewY,NewWidth,NewHeight,TRUE);
Последний параметр TRUE (по умолчанию) предназначен для немедленной перерисовки.