Во-первых, в своем классе bootstrap убедитесь, что у вас есть аннотация @EnableAutoConfiguration. Если у вас есть @SpringBootApplication, этого должно быть достаточно, поскольку последний аннотируется первым.
@SpringBootApplication
public class MyApp {
public static void main(String[] args) {
SpringApplication.run(MyApp.class, args);
}
}
Второе, убедитесь, что UserRepository расширяет JpaRepository или CrudRepository:
public interface UserRepository extends JpaRepository<User, Long> {}
Наконец, проверьте правильность зависимости в конфигурации maven или gradle. Например,
<dependency>
<groupId>org.springframework.boot</groupId>
<artifactId>spring-boot-starter-data-jpa</artifactId>
</dependency>