Ваш вопрос не ясен, я предполагаю, что вы хотите увеличить значение счетчика для данного идентификатора:
self.mycursor = self.mydb.cursor()
self.sql1 = "UPDATE counter SET count = count + 1 WHERE id = %s"
self.mycursor.execute(self.sql1, self.val1)
self.mydb.commit()