Почему notebook () не работает для IJulia? - PullRequest
Новая
       70

Почему notebook () не работает для IJulia?

1 голос
/ 24 января 2020

Я получаю эту проблему при попытке использовать notebook() в Julia (REPL интерфейса командной строки) 

julia> using IJulia
[ Info: Precompiling IJulia [7073ff75-c697-5162-941a-fcdaad2a7d2a]

julia> notebook()
[ Info: running setenv(`/root/miniconda3/bin/jupyter notebook`,["_CE_M=", "LSCOLORS=Gxfxcxdxbxegedabagacad", "PATH=/root/miniconda3/bin:/root/miniconda3/bin:/root/miniconda3/condabin:/bin:/usr/bin:/sbin:/usr/sbin:/root/julia-1.3.1/bin", "QT_ACCESSIBILITY=1", "DBUS_SESSION_BUS_ADDRESS=unix:path=/run/user/0/bus", "XDG_SEAT_PATH=/org/freedesktop/DisplayManager/Seat0", "XDG_SESSION_DESKTOP=GNOME", "SSH_AGENT_PID=2661", "XDG_SESSION_TYPE=x11", "QT_IM_MODULE=ibus", "USER=root", "PAM_KWALLET5_LOGIN=/run/user/0/kwallet5.socket", "LESS=-R", "CONDA_PROMPT_MODIFIER=(base) ", "XDG_DATA_DIRS=/usr/share/gnome:/root/.local/share/flatpak/exports/share:/var/lib/flatpak/exports/share:/usr/local/share:/usr/share", "CLUTTER_IM_MODULE=ibus", "SHELL=/usr/bin/zsh", "GJS_DEBUG_OUTPUT=stderr", "XAUTHORITY=/root/.Xauthority", "XDG_MENU_PREFIX=gnome-", "GTK_MODULES=gail:atk-bridge", "GTK_IM_MODULE=ibus", "MANAGERPID=2575", "SESSION_MANAGER=local/kali:@/tmp/.ICE-unix/2753,unix/kali:/tmp/.ICE-unix/2753", "XMODIFIERS=@im=ibus", "_CE_CONDA=", "CONDA_SHLVL=1", "CONDA_EXE=/root/miniconda3/bin/conda", "HOME=/root", "TERM=xterm-256color", "COLORTERM=truecolor", "VTE_VERSION=5802", "CONDA_PYTHON_EXE=/root/miniconda3/bin/python", "INVOCATION_ID=a29cdf2f60b140acb65b8e9d69af5b77", "IM_CONFIG_PHASE=1", "XDG_CURRENT_DESKTOP=GNOME", "LANG=C.UTF-8", "LOGNAME=root", "GNOME_DESKTOP_SESSION_ID=this-is-deprecated", "XDG_RUNTIME_DIR=/run/user/0", "SHLVL=1", "SSH_AUTH_SOCK=/run/user/0/keyring/ssh", "DESKTOP_SESSION=/usr/share/xsessions/gnome-xorg", "OLDPWD=/root", "_=/root/julia-1.3.1/bin/julia", "PAGER=less", "CONDA_DEFAULT_ENV=base", "GPG_AGENT_INFO=/run/user/0/gnupg/S.gpg-agent:0:1", "GNOME_TERMINAL_SCREEN=/org/gnome/Terminal/screen/73a7f463_14d7_4c04_adfb_a849e0d337b9", "ZSH=/root/.oh-my-zsh", "GNOME_TERMINAL_SERVICE=:1.261", "PWD=/root/JuliaPro-1.2.0-2", "XDG_SESSION_CLASS=user", "DISPLAY=:0", "GJS_DEBUG_TOPICS=JS ERROR;JS LOG", "XDG_SESSION_PATH=/org/freedesktop/DisplayManager/Session1", "CONDA_PREFIX=/root/miniconda3", "JOURNAL_STREAM=9:29944", "QT4_IM_MODULE=ibus", "LS_COLORS=rs=0:di=01;34:ln=01;36:mh=00:pi=40;33:so=01;35:do=01;35:bd=40;33;01:cd=40;33;01:or=40;31;01:mi=00:su=37;41:sg=30;43:ca=30;41:tw=30;42:ow=34;42:st=37;44:ex=01;32:*.tar=01;31:*.tgz=01;31:*.arc=01;31:*.arj=01;31:*.taz=01;31:*.lha=01;31:*.lz4=01;31:*.lzh=01;31:*.lzma=01;31:*.tlz=01;31:*.txz=01;31:*.tzo=01;31:*.t7z=01;31:*.zip=01;31:*.z=01;31:*.dz=01;31:*.gz=01;31:*.lrz=01;31:*.lz=01;31:*.lzo=01;31:*.xz=01;31:*.zst=01;31:*.tzst=01;31:*.bz2=01;31:*.bz=01;31:*.tbz=01;31:*.tbz2=01;31:*.tz=01;31:*.deb=01;31:*.rpm=01;31:*.jar=01;31:*.war=01;31:*.ear=01;31:*.sar=01;31:*.rar=01;31:*.alz=01;31:*.ace=01;31:*.zoo=01;31:*.cpio=01;31:*.7z=01;31:*.rz=01;31:*.cab=01;31:*.wim=01;31:*.swm=01;31:*.dwm=01;31:*.esd=01;31:*.jpg=01;35:*.jpeg=01;35:*.mjpg=01;35:*.mjpeg=01;35:*.gif=01;35:*.bmp=01;35:*.pbm=01;35:*.pgm=01;35:*.ppm=01;35:*.tga=01;35:*.xbm=01;35:*.xpm=01;35:*.tif=01;35:*.tiff=01;35:*.png=01;35:*.svg=01;35:*.svgz=01;35:*.mng=01;35:*.pcx=01;35:*.mov=01;35:*.mpg=01;35:*.mpeg=01;35:*.m2v=01;35:*.mkv=01;35:*.webm=01;35:*.ogm=01;35:*.mp4=01;35:*.m4v=01;35:*.mp4v=01;35:*.vob=01;35:*.qt=01;35:*.nuv=01;35:*.wmv=01;35:*.asf=01;35:*.rm=01;35:*.rmvb=01;35:*.flc=01;35:*.avi=01;35:*.fli=01;35:*.flv=01;35:*.gl=01;35:*.dl=01;35:*.xcf=01;35:*.xwd=01;35:*.yuv=01;35:*.cgm=01;35:*.emf=01;35:*.ogv=01;35:*.ogx=01;35:*.aac=00;36:*.au=00;36:*.flac=00;36:*.m4a=00;36:*.mid=00;36:*.midi=00;36:*.mka=00;36:*.mp3=00;36:*.mpc=00;36:*.ogg=00;36:*.ra=00;36:*.wav=00;36:*.oga=00;36:*.opus=00;36:*.spx=00;36:*.xspf=00;36:", "OPENBLAS_MAIN_FREE=1"])
Process(setenv(`/root/miniconda3/bin/jupyter notebook`,["_CE_M=", "LSCOLORS=Gxfxcxdxbxegedabagacad", "PATH=/root/miniconda3/bin:/root/miniconda3/bin:/root/miniconda3/condabin:/bin:/usr/bin:/sbin:/usr/sbin:/root/julia-1.3.1/bin", "QT_ACCESSIBILITY=1", "DBUS_SESSION_BUS_ADDRESS=unix:path=/run/user/0/bus", "XDG_SEAT_PATH=/org/freedesktop/DisplayManager/Seat0", "XDG_SESSION_DESKTOP=GNOME", "SSH_AGENT_PID=2661", "XDG_SESSION_TYPE=x11", "QT_IM_MODULE=ibus"  …  "PWD=/root/JuliaPro-1.2.0-2", "XDG_SESSION_CLASS=user", "DISPLAY=:0", "GJS_DEBUG_TOPICS=JS ERROR;JS LOG", "XDG_SESSION_PATH=/org/freedesktop/DisplayManager/Session1", "CONDA_PREFIX=/root/miniconda3", "JOURNAL_STREAM=9:29944", "QT4_IM_MODULE=ibus", "LS_COLORS=rs=0:di=01;34:ln=01;36:mh=00:pi=40;33:so=01;35:do=01;35:bd=40;33;01:cd=40;33;01:or=40;31;01:mi=00:su=37;41:sg=30;43:ca=30;41:tw=30;42:ow=34;42:st=37;44:ex=01;32:*.tar=01;31:*.tgz=01;31:*.arc=01;31:*.arj=01;31:*.taz=01;31:*.lha=01;31:*.lz4=01;31:*.lzh=01;31:*.lzma=01;31:*.tlz=01;31:*.txz=01;31:*.tzo=01;31:*.t7z=01;31:*.zip=01;31:*.z=01;31:*.dz=01;31:*.gz=01;31:*.lrz=01;31:*.lz=01;31:*.lzo=01;31:*.xz=01;31:*.zst=01;31:*.tzst=01;31:*.bz2=01;31:*.bz=01;31:*.tbz=01;31:*.tbz2=01;31:*.tz=01;31:*.deb=01;31:*.rpm=01;31:*.jar=01;31:*.war=01;31:*.ear=01;31:*.sar=01;31:*.rar=01;31:*.alz=01;31:*.ace=01;31:*.zoo=01;31:*.cpio=01;31:*.7z=01;31:*.rz=01;31:*.cab=01;31:*.wim=01;31:*.swm=01;31:*.dwm=01;31:*.esd=01;31:*.jpg=01;35:*.jpeg=01;35:*.mjpg=01;35:*.mjpeg=01;35:*.gif=01;35:*.bmp=01;35:*.pbm=01;35:*.pgm=01;35:*.ppm=01;35:*.tga=01;35:*.xbm=01;35:*.xpm=01;35:*.tif=01;35:*.tiff=01;35:*.png=01;35:*.svg=01;35:*.svgz=01;35:*.mng=01;35:*.pcx=01;35:*.mov=01;35:*.mpg=01;35:*.mpeg=01;35:*.m2v=01;35:*.mkv=01;35:*.webm=01;35:*.ogm=01;35:*.mp4=01;35:*.m4v=01;35:*.mp4v=01;35:*.vob=01;35:*.qt=01;35:*.nuv=01;35:*.wmv=01;35:*.asf=01;35:*.rm=01;35:*.rmvb=01;35:*.flc=01;35:*.avi=01;35:*.fli=01;35:*.flv=01;35:*.gl=01;35:*.dl=01;35:*.xcf=01;35:*.xwd=01;35:*.yuv=01;35:*.cgm=01;35:*.emf=01;35:*.ogv=01;35:*.ogx=01;35:*.aac=00;36:*.au=00;36:*.flac=00;36:*.m4a=00;36:*.mid=00;36:*.midi=00;36:*.mka=00;36:*.mp3=00;36:*.mpc=00;36:*.ogg=00;36:*.ra=00;36:*.wav=00;36:*.oga=00;36:*.opus=00;36:*.spx=00;36:*.xspf=00;36:", "OPENBLAS_MAIN_FREE=1"]; dir="/root"), ProcessExited(1))

Это очень запутанно и, скорее всего, проблема новичка.

Как и предполагалось @SalchiPapa, вот моя версия информации: 

Julia Version 1.3.1
Commit 2d5741174c (2019-12-30 21:36 UTC)
Platform Info:
  OS: Linux (x86_64-pc-linux-gnu)
  CPU: Intel(R) Core(TM) i3-6006U CPU @ 2.00GHz
  WORD_SIZE: 64
  LIBM: libopenlibm
  LLVM: libLLVM-6.0.1 (ORCJIT, skylake)

Кроме того, jupyter notebook запускает локальный хост для меня, но в ядре продолжают появляться ошибки для julia-1.3.1. Это не работает для меня, так как показывает эту ошибку: ERROR: LoadError: Blosc not installed properly, run Pkg.build("ZMQ"), restart Julia and try again и эту одновременно: ERROR: LoadError: Failed to precompile ZMQ [c2297ded-f4af-51ae-bb23-16f91089e4e1] to /root/.julia/compiled/v1.3/ZMQ/CaaO6_riTu7.ji.

Вручную пытались Pkg.add и Pkg.build каждый из ZMQ, Blos c и CMake, но безуспешно.

1 Ответ

2 голосов
/ 25 января 2020

Наконец-то нашли решение. Большое спасибо @ SalchiPapa , который нашел время, чтобы лично позвонить мне и решить проблему. Решение сейчас состоит в том, чтобы не запускать IJulia с root

Что сработало для меня:

$su user-not-root

$julia

using IJulia;notebook(detached=true) Это должно показать ProcessRunning в конце.

run(path/to/jupyter notebook list) с парой обратных символов внутри run ().

Это дало мне URL и токен, добавленные к нему. Это хорошо сработало.

Я предлагаю сообществу помочь решить эту проблему. Я связал этот ответ с проблемой Github здесь

...