Нет, это невозможно сделать. Редактор для файла в маркере всегда используется.
Открытие файла выполняется с помощью IDE.openEditor
API, так же, как открывается обычный файл. Это делается в базовом классе org.eclipse.ui.internal.views.markers.ExtendedMarkersView
для представлений маркеров в методе openMarkerInEditor
.