Я пытался использовать Rmarkdown для первого раза, чтобы сгенерировать PDF и получил сообщения об ошибках.
Я пытался скачать текстовый файл здесь http://www.tug.org/texlive/acquire-netinstall.html "install-tl-unx.tar.gz (4mb)", но я не совсем понял инструкцию по установке и не уверен если это правильное решение для моей проблемы.
Ошибка, которую я получил:
! Пакет pdftex.def Ошибка: файл `http://www.compbio.dundee.ac.uk/user/pschofie ld / Projects / training_pg // figure / openmarkdown.png 'не найден: используется черновик настроек.
Ошибка: не удалось скомпилировать LaTeX РНК-сл-анализ-1 --- Введение к R, -RStudio-и-Rmarkdown-.tex. См. https://yihui.org/tinytex/r/#debugging для подсказок отладки. См. RNA-seq-Analysis-1 --- Введение-в-R, -RStudio-и-Rmarkdown-.log для получения дополнительной информации. Выполнение остановлено
Установка LaTeX не обнаружена (LaTeX требуется для создания вывода PDF). Вам следует установить дистрибутив LaTeX для вашей платформы: https://www.latex-project.org/get/
Если вы не уверены, вы можете установить TinyTeX в R: tinytex :: install_tinytex ()
В противном случае рассмотрите MiKTeX на Windows - http://miktex.org
MacTeX на macOS - https://tug.org/mactex/ (ПРИМЕЧАНИЕ: загрузка с Safari вместо Chrome настоятельно рекомендуется)
Linux: использовать диспетчер системных пакетов