Я новичок в биоинформатике и python вообще, но сейчас пытаюсь это изменить. Я хочу использовать скрипт python, который позволяет мне загружать файлы fasta из базы данных Human Microbiome Porject (HMP). Я получаю скрипт на собственной странице github HMP.
Я прочитал в инструкции по использованию, что для запуска файла setup.py это должно быть сделано непосредственно в командной строке commnad, используя python команда. Итак, я установил путь к файлу и сделал следующее в моем windows 10 cmd:
C:\Users\56998\Documents\R\HMP\portal_client-master> python setup.py
, но вместо желаемого вывода выдается это предупреждение:
WARNING: '' not a valid package name; please use only .-separated package names in setup.py
usage: setup.py [global_opts] cmd1 [cmd1_opts] [cmd2 [cmd2_opts] ...]
or: setup.py --help [cmd1 cmd2 ...]
or: setup.py --help-commands
or: setup.py cmd --help
error: no commands supplied
Я не знаю, что это значит и, очевидно, как это исправить. Буду признателен за вашу помощь