Аргумент sec.axis
только создает новую ось, но не меняет ваши данные и не может использоваться для построения данных.
Чтобы иметь возможность наносить данные из двух групп с большим диапазоном, сначала необходимо уменьшить SA1.
Здесь я уменьшил его, разделив его на 100 (потому что отношение между максимальным значением SA1 и максимальным значением SA и SA2 близко к 100), и я также изменил ваш фрейм данных в более длинный формат, более подходящий для ggplot2
:
library(lubridate)
df$year = parse_date_time(df$year, orders = "%Y") # To set year in a date format
library(dplyr)
library(tidyr)
DF <- df %>% mutate(SA1_100 = SA1/100) %>% pivot_longer(.,-year, names_to = "Var",values_to = "val")
# A tibble: 44 x 3
year Var val
<int> <chr> <dbl>
1 2008 SA 1.41e15
2 2008 SA1 3.63e17
3 2008 SA2 4.07e15
4 2008 SA1_100 3.63e15
5 2009 SA 1.53e15
6 2009 SA1 3.77e17
7 2009 SA2 4.05e15
8 2009 SA1_100 3.77e15
9 2010 SA 1.52e15
10 2010 SA1 3.56e17
# … with 34 more rows
Затем вы можете построить его, используя (я поднабор данных, чтобы удалить «SA1» и сохранить преобразованный столбец «SA1_100»):
library(ggplot2)
ggplot(subset(DF, Var != "SA1"), aes(x = year, y = val, color = Var))+
geom_line()+
scale_y_continuous(name = "Primary axis", sec.axis = sec_axis(~.*100, name = "Secondary"))

Кстати, в ggplot2
вам не нужно проектировать столбец, используя $, просто напишите его имя.
Данные
structure(list(year = 2008:2018, SA = c(1.40916e+15, 1.5336e+15,
1.52473e+15, 1.58394e+15, 1.59702e+15, 1.54936e+15, 1.6077e+15,
1.59211e+15, 1.73533e+15, 1.7616e+15, 1.67771e+15), SA1 = c(3.63e+17,
3.77e+17, 3.56e+17, 3.68e+17, 3.68e+17, 3.6e+17, 3.6e+17, 3.68e+17,
3.55e+17, 3.58e+17, 3.43e+17), SA2 = c(4.07e+15, 4.05e+15, 3.94e+15,
3.95e+15, 3.59e+15, 3.53e+15, 3.43e+15, 3.2e+15, 3.95e+15, 3.03e+15,
3.16e+15)), row.names = c(NA, -11L), class = c("data.table",
"data.frame"), .internal.selfref = <pointer: 0x56412c341350>)