KeyError: в мульти-лейбле U-net - PullRequest
       102

KeyError: в мульти-лейбле U-net

0 голосов
/ 12 апреля 2020

У меня есть одно изображение в качестве входных данных и две маски, я использовал мульти-метку Unet, процесс обучения работает без проблем, но когда я пытаюсь получить прогноз, Id обнаружил ошибку (KeyError:) для генератора тестов I использовал кусочек трески

def testGenerator(test_path= "data/membrane/test/image",num_image = 1584,target_size = (224,224),flag_multi_class = False,as_gray = False):
for i in range(num_image):
    img = io.imread(os.path.join(test_path,"%d.jpg"%i),as_gray = as_gray)
    img = img / 255.
    img = trans.resize(img,target_size)
    img = np.reshape(img,img.shape) if (not flag_multi_class) else img
    img = np.reshape(img,(1,)+img.shape)
    yield img

и для визуализации я использовал

def labelVisualize(num_class,color_dict,img):
     img = img[:,:,0] if len(img.shape) == 3 else img
     img_out = np.zeros(img.shape + (3,))
     for i in range(num_class):
     img_out[img == i,:] = color_dict[i]
     return img_out / 255


def saveResult(save_path,npyfile,flag_multi_class = False,num_class = 2):
    for i,item in enumerate(npyfile):
         img = labelVisualize(num_class,COLOR_DICT,item) if flag_multi_class else item[:,:,0]
         io.imsave(os.path.join(save_path,"%d_predict.tif"%(i)), os.path.join(save_path,"%d_predict.tif"%(i)),skimage.img_as_ubyte(img))

трассировку, как показано:

KeyError                       Traceback (most recent call last)
<ipython-input-29-60fe459f67b9> in <module>
      4 results = model.predict_generator(testGene,10,verbose=1)
      5 #saveResult("data/membrane/test/results",results)
----> 6 saveResult("data/membrane/test/results/road",results)
      7 saveResult("data/membrane/test/results/cl",results)

<ipython-input-26-6c6016bc75cc> in saveResult(save_path, npyfile, flag_multi_class, num_class)
      26     for i,item in enumerate(npyfile):
      27         img = labelVisualize(num_class,COLOR_DICT,item) if  flag_multi_class else item[:,:,0]
 ---> 28         io.imsave(os.path.join(save_path,"%d_predict.tif"%    (i)), os.path.join(save_path,"%d_predict.tif"%  (i)),skimage.img_as_ubyte(img))

/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/skimage/io/_io.py in imsave(fname, arr, plugin, **plugin_args)
     137         if fname.lower().endswith(('.tiff', '.tif')):
     138             plugin = 'tifffile'
 --> 139     if is_low_contrast(arr):
     140         warn('%s is a low contrast image' % fname)
     141     if arr.dtype == bool:

  /anaconda3/lib/python3.6/site-packages/skimage/exposure/exposure.py in is_low_contrast(image, fraction_threshold, lower_percentile, upper_percentile, method)
     501         image = rgb2gray(image)
     502 
 --> 503     dlimits = dtype_limits(image, clip_negative=False)
     504     limits = np.percentile(image, [lower_percentile, upper_percentile])
     505     ratio = (limits[1] - limits[0]) / (dlimits[1] - dlimits[0])

 /anaconda3/lib/python3.6/site-packages/skimage/util/dtype.py in dtype_limits(image, clip_negative)
      55         warn('The default of `clip_negative` in `skimage.util.dtype_limits` '
      56              'will change to `False` in version 0.15.')
 ---> 57     imin, imax = dtype_range[image.dtype.type]
      58     if clip_negative:
      59         imin = 0

KeyError: <class 'numpy.str_'>

Мне нужно получить две предсказанные маски для Каждое изображение в тестовом наборе данных и сохранить его в отдельных папках, любая идея для решения этой проблемы будет признателен, заранее спасибо

1 Ответ

0 голосов
/ 13 апреля 2020

Вы передаете один и тот же аргумент os.path.join(save_path,"%d_predict.tif"%(i)) дважды imsave(), но он должен быть передан только один раз. Вот почему ничего не работает, потому что когда imsave() проверяет, какой тип данных содержится в вашем массиве, аргумент массива фактически является именем файла во второй раз, и это не имеет смысла.

Передайте путь к файлу просто один раз до imsave().

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...