Как я могу использовать вывод Tukey HSD для создания компактного буквенного дисплея для ggplot? - PullRequest
0 голосов
/ 03 мая 2020

На самом деле вырвал мои волосы, потому что я искал, как кодировать это весь день!

Есть ли простой способ использовать вывод из Tukey HSD для создания компактного отображения букв на ggplot? ?

Вот мой код Tukey HSD и вывод для Tukey HSD

model2a<-aov(ChlorophyllSq~Treatment*Depth, data= Chloro_day1)
summary(model2a)
TukeyHSDG3 <- TukeyHSD(model2a)

Вывод для этого:

$`Treatment:Depth`
                diff          lwr          upr     p adj
1:0-4:0 -0.22553886 -0.453050360  0.001972637 0.0539570
2:0-4:0  0.08538540 -0.142126102  0.312896895 0.9479148
3:0-4:0  0.13881631 -0.088695190  0.366327807 0.5837634
4:1-4:0 -0.11860442 -0.346115918  0.108907079 0.7605038
1:1-4:0 -0.32883710 -0.556348601 -0.101325604 0.0003326
2:1-4:0 -0.10558438 -0.333095877  0.121927120 0.8530927
3:1-4:0 -0.06751487 -0.295026371  0.159996627 0.9859703
2:0-1:0  0.31092426  0.083412759  0.538435757 0.0009340
3:0-1:0  0.36435517  0.136843672  0.591866669 0.0000363
4:1-1:0  0.10693444 -0.120577057  0.334445940 0.8445680
1:1-1:0 -0.10329824 -0.330809739  0.124213258 0.8669147
2:1-1:0  0.11995448 -0.107557015  0.347465982 0.7497017
3:1-1:0  0.15802399 -0.069487509  0.385535488 0.4094089
3:0-2:0  0.05343091 -0.174080586  0.280942411 0.9966252
4:1-2:0 -0.20398982 -0.431501315  0.023521682 0.1167876
1:1-2:0 -0.41422250 -0.641733997 -0.186711000 0.0000011
2:1-2:0 -0.19096977 -0.418481273  0.036541724 0.1762182
3:1-2:0 -0.15290027 -0.380411767  0.074611230 0.4545645
4:1-3:0 -0.25742073 -0.484932227 -0.029909230 0.0141612
1:1-3:0 -0.46765341 -0.695164909 -0.240141912 0.0000000
2:1-3:0 -0.24440069 -0.471912186 -0.016889189 0.0251239
3:1-3:0 -0.20633118 -0.433842679  0.021180318 0.1079735
1:1-4:1 -0.21023268 -0.437744181  0.017278816 0.0944567
2:1-4:1  0.01302004 -0.214491457  0.240531540 0.9999998
3:1-4:1  0.05108955 -0.176421951  0.278601046 0.9974563
2:1-1:1  0.22325272 -0.004258775  0.450764222 0.0588699
3:1-1:1  0.26132223  0.033810732  0.488833729 0.0118425
3:1-2:1  0.03806951 -0.189441992  0.265581005 0.9996237    

Я пытался применить этот пример к мои данные, но я получаю сообщение об ошибке из-за взаимодействия Как создать компактный буквенный дисплей для парного TukeyHSD

glht(model2a, infct=mcp(Treatment*Depth="Tukey") 

Любые рекомендации или помощь будет высоко ценится?

Спасибо!

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...