Ошибка в mcp2matrix (модель, linfct = linfct) glht - PullRequest
Новая
       112

Ошибка в mcp2matrix (модель, linfct = linfct) glht

1 голос
/ 09 июля 2020

Я хочу провести тест Тьюки на своих данных и нашел для него код . Мне потребовалось некоторое время, чтобы применить его к моим данным, и я получил ошибку выше, когда я добрался до glht. Я подумал, что, может быть, я допустил опечатку в своих данных, поэтому я проверил ее с демонстрационными данными, но получаю ту же ошибку:

Ошибка в mcp2matrix (model, linfct = linfct): Variable (s) 'X «символ класса» есть / не содержится в качестве фактора в «модели».

Это демонстрационные данные: 

           Y X
1  0.2855104 A
2  0.3385240 A
3  0.0883132 A
4  0.2059308 A
5  0.3632401 A
6  0.5217391 B
7  0.7633588 B
8  0.3254679 B
9  0.4253057 B
10 0.3780718 B
11 0.9891197 C
12 1.1927181 C
13 0.7882883 C
14 0.5491762 C
15 0.5445882 C
16 1.2670565 D
17 1.6253208 D
18 1.2661090 D
19 1.1541876 D
20 1.2684989 D
21 1.0695187 D

Это полный код: 

install.packages("multcomp")
expt1 <- read.table("demo.txt",header=T)
amod <- aov(Y~X,data=expt1)
summary(amod)
library("multcomp")
tmod <- glht(amod,linfct=mcp(X="Tukey"))

И вот как это отображается в R (после установки пакетов): 

> expt1 <- read.table("demo.txt",header=T)
> amod <- aov(Y~X,data=expt1)
> summary(amod)
            Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)    
X            3  3.244  1.0815   27.59 9.26e-07 ***
Residuals   17  0.666  0.0392                     
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
> library("multcomp")
Loading required package: mvtnorm
Loading required package: survival
Loading required package: TH.data
Loading required package: MASS

Attaching package: ‘TH.data’

The following object is masked from ‘package:MASS’:

    geyser

> tmod <- glht(amod,linfct=mcp(X="Tukey"))
Error in mcp2matrix(model, linfct = linfct) : 
  Variable(s) ‘X’ of class ‘character’ is/are not contained as a factor in ‘model’.

Я совершенно новый ie и я полностью в тупике. Что я делаю не так?

...