«Ошибка установщика ...» При попытке использовать функцию lrm из библиотеки rms - PullRequest
1 голос
/ 16 июня 2020

Я пытаюсь запустить небольшую таблицу данных с помощью функции lrm из библиотеки rms, но каждый раз, когда я запускаю ее, я получаю следующее:

Error in fitter(X, Y, offset = offs, penalty.matrix = penalty.matrix,  : 
NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)

Вот воспроизводимый код:

library(tidyverse)
library(rms)

data <- tribble(
~a, ~b, ~c,
"name", 2, 77.95535,
"name", 2, 81.36152,
"name", 2, 80.87081,
"name", 2, 80.59054,
"name", 2, 79.36807,
"name", 2, 82.42083,
"name", 2, 78.80646,
"name", 2, 78.88949
)

lmod <- lrm(b~c, data, penalty=0, x=T, y=T, tol=1e-10, maxit=1e6)

Пробовал много чего. Я попытался переключить b ~ c на c ~ b (я знаю, что это не даст те же данные), и я получил ошибку, но не ту же ошибку. Я пробовал использовать только первые два параметра, а также различные, включая или исключая следующие. Я также пробовал отлаживать и следовать коду в функции lrm, и я сузил его до (шокирующей) функции установщика.

Вот некоторые ресурсы, которые я использовал, которые вы могли бы найти полезными для себя или помочь мне. Если есть что-то, что я забыл добавить, напишите комментарий, и я заполню все, что смогу :) Спасибо!

R Справочное руководство

lrm Описание функции

R для науки о данных (книга)

lrm Исходный код функции

1 Ответ

1 голос
/ 16 июня 2020

Я получаю ту же ошибку, используя предоставленные вами данные. Затем я изменил некоторые b на 1, ошибка исчезла:

data <- tribble(
  ~a, ~b, ~c,
  "name", 2, 77.95535,
  "name", 2, 81.36152,
  "name", 1, 80.87081,
  "name", 1, 80.59054,
  "name", 2, 79.36807,
  "name", 1, 82.42083,
  "name", 1, 78.80646,
  "name", 2, 78.88949
)

lmod <- lrm(b~c, data = data, penalty=0, x=TRUE, y=TRUE, tol=1e-14, maxit=1e10)
lmod

Logistic Regression Model

 lrm(formula = b ~ c, data = data, x = TRUE, y = TRUE, penalty = 0, 
     tol = 1e-14, maxit = 1e+10)

                   Model Likelihood    Discrimination    Rank Discrim.    
                         Ratio Test           Indexes          Indexes    
 Obs         8    LR chi2      0.00    R2       0.000    C       0.500    
  1          4    d.f.            1    g        0.000    Dxy     0.000    
  2          4    Pr(> chi2) 1.0000    gr       1.000    gamma   0.000    
 max |deriv| 3                         gp       0.000    tau-a   0.000    
                                       Brier    0.250                     

           Coef   S.E.    Wald Z Pr(>|Z|)
 Intercept 0.0000 39.9600 0.00   1.0000  
 c         0.0000  0.4992 0.00   1.0000 

Я знаю, что это только подмножество ваших данных, но, может быть, все строки в b имеют значение 2? Вы можете проверить это, например, table(data$b)

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...