Создание дерева phylogeneti c вместе с штрих-графиками - PullRequest
0 голосов
/ 03 августа 2020

Я хотел бы создать дерево phylogeneti c для 3 животных, а затем показать определенное значение рядом с деревом phylogeneti c в виде графиков. Примером могут быть данные, показанные на прилагаемом рисунке. Есть ли возможность сделать это в python?

Файл дерева Ньюика:

((((((((((((((( (((((((((((Monodelphis_domestica) Monodelphis) Didelphinae) Didelphidae) Didelphimorphia) Metatheria, (((((((((((Mus_musculus) Mus) Mus) Murinae) Muridae) Muroidea) Myomorpha, (( (((Marmota_marmota) Marmota) Marmotini) Xerinae) Sciuridae) Sciuromorpha) Rodentia) Glires) Euarchontoglires) Boreoeutheria) Eutheria) Theria) Mammalia) Amniota) Tetrapoda) Dipnotetrapodomomiatagomiata) Carcoostatteromata) Carcoostatomorphaii) Dipnotetrapodomiata) Carcoostromatomorphaii) Dipnotetrapodomiata ) Bilateria) Eumetazoa) Metazoa) Opisthokonta) Eukaryota) cell_organisms) OROOT;

и значения штрихового графика для животных:

Monodelphis_domestica: 2.7 Mus_musculus: 5.2 Marmota_marmota 4.8

Вот как я хочу, чтобы моя фигура выглядела. Рис. 3 этой исследовательской статьи (https://doi.org/10.7717/peerj.3454).

...