Ошибка при запуске NLRX (NetLo go) в Manjaro (Arch) Linux - PullRequest
Новая
       95

Ошибка при запуске NLRX (NetLo go) в Manjaro (Arch) Linux

1 голос
/ 06 мая 2020

Я пытаюсь запустить симуляцию NLRX в Manjaro Linux (RNetLo go тоже не работает по какой-то причине), и при попытке установить фиктивный эксперимент я сталкиваюсь со следующей ошибкой: 

    cp: cannot stat '~/.netlogo/NetLogo 6.1.1/netlogo-headless.sh': No such file or directory
    sed: can't read /tmp/Rtmpj15Yf7/netlogo-headless365385fb4bdc0.sh: No such file or directory
    sed: can't read /tmp/Rtmpj15Yf7/netlogo-headless365385fb4bdc0.sh: No such file or directory
    sh: /tmp/Rtmpj15Yf7/netlogo-headless365385fb4bdc0.sh: No such file or directory
    Error in util_gather_results(nl, outfile, seed, siminputrow) : 
      Temporary output file /tmp/Rtmpj15Yf7/nlrx5493_1365385ab03157.csvnot found. On unix systems this can happen if the default system temp folder is used.
                    Try reassigning the default temp folder for this R session (unixtools package).
    In addition: Warning message:
    In system(NLcall, wait = TRUE) : error in running command

Учитывая, что я использую R 4.0.0, пакет Unixtools не работает, поэтому об этом не может быть и речи. Как мне go исправить это?

Код для любопытных: 

library(nlrx)

netlogopath <- file.path("~/.netlogo/NetLogo 6.1.1")
modelpath <- file.path(netlogopath, "app/models/Sample Models/Biology/Wolf Sheep Predation.nlogo")
outpath <- file.path("/home/out")
nl <- nl(nlversion = "6.0.3",
         nlpath = netlogopath,
         modelpath = modelpath,
         jvmmem = 1024)
nl@experiment <- experiment(expname="wolf-sheep",
                            outpath=outpath,
                            repetition=1,
                            tickmetrics="true",
                            idsetup="setup",
                            idgo="go",
                            runtime=50,
                            evalticks=seq(40,50),
                            metrics=c("count sheep", "count wolves", "count patches with [pcolor = green]"),
                            variables = list('initial-number-sheep' = list(min=50, max=150, qfun="qunif"),
                                             'initial-number-wolves' = list(min=50, max=150, qfun="qunif")),
                            constants = list("model-version" = "\"sheep-wolves-grass\"",
                                             "grass-regrowth-time" = 30,
                                             "sheep-gain-from-food" = 4,
                                             "wolf-gain-from-food" = 20,
                                             "sheep-reproduce" = 4,
                                             "wolf-reproduce" = 5,
                                             "show-energy?" = "false"))
nl@simdesign <- simdesign_lhs(nl=nl,
                              samples=100,
                              nseeds=3,
                              precision=3)
results <- run_nl_all(nl = nl)

Версия R для тех, кому она может понадобиться: 

platform       x86_64-pc-linux-gnu         
arch           x86_64                      
os             linux-gnu                   
system         x86_64, linux-gnu           
status                                     
major          4                           
minor          0.0                         
year           2020                        
month          04                          
day            24                          
svn rev        78286                       
language       R                           
version.string R version 4.0.0 (2020-04-24)
nickname       Arbor Day
...