Мне было трудно получить vmd_box_dims. sh сценарий, который взаимодействует с VMD, чтобы получить размеры решенного блока.
Когда я пытаюсь запустить сценарий, как показано ниже, я получаю соответствующую ошибку:
. / Vmd_box_dims. sh -i DMPC_72_relax.pdb -s water
. / Vmd_box_dims. sh: строка 41: vmd: команда не найдена
( standard_in) 2: синтаксическая ошибка
(standard_in) 2: синтаксическая ошибка
(standard_in) 2: синтаксическая ошибка