Теги уровня стека устанавливаются с помощью интерфейса командной строки, SDK или консоли при развертывании шаблона. Он должен работать независимо от того, используете вы Jenkins или нет, поскольку jenkis также должен будет использовать CLI или SDK (в зависимости от вашей настройки).
Теги уровня стека :
Все теги на уровне стека, включая автоматически созданные теги, распространяются на ресурсы, которые поддерживает AWS CloudFormation. В настоящее время теги не распространяются на тома Amazon EBS, созданные из сопоставлений блочных устройств.
Надеюсь, это поможет.
ps. Вы не можете установить их изнутри шаблона, так как они устанавливаются при его развертывании.