Размер диаграммы Тейлора, цвет, аргумент сохранения? - PullRequest
Новая
       23

Размер диаграммы Тейлора, цвет, аргумент сохранения?

0 голосов
/ 06 мая 2020

Я создал диаграмму Тейлора с использованием библиотеки: 

library(plotrix)
library(rJava)
library(xlsxjars)
library(readxl)
library(xlsx)

и используемых данных dput(df)

structure(list(Pb = c(12.54, 12.53, 13.57, 19.22, 22.27, 18.37, 
19, 14.34, 16.35), Boruta_XGBoost = c(8.89136409759521, 8.85756206512451, 
8.21786308288574, 12.9624891281128, 13.2968854904175, 12.7977981567383, 
12.3957328796387, 9.69775390625, 11.781777381897), Boruta_SVM = c(12.8297886877439, 
14.1176611943491, 14.9879296831078, 18.1703565549757, 19.5840584003096, 
18.8792561701891, 16.2778795502105, 13.4901086669503, 14.2836465797069
), Boruta_RF = c(14.3177444444444, 11.1845266666667, 10.8805244444444, 
17.6771022222222, 20.7142466666667, 18.5657155555556, 16.8954355555556, 
12.9909844444444, 15.9368244444444), GA_XGBoost = c(8.90407180786133, 
8.7996244430542, 8.19470405578613, 12.927845954895, 13.1713933944702, 
12.896990776062, 12.4013185501099, 9.44187641143799, 11.9617586135864
), GA_SVM = c(14.5574045001675, 14.7111528658119, 14.5103784219767, 
17.6100336774524, 19.0957864342351, 17.836320761182, 15.7884998778531, 
13.2352198846198, 14.7596456378561), GA_RF = c(13.7602755555556, 
11.43164, 10.6581822222222, 18.0504933333333, 20.8309088888889, 
18.5738422222222, 16.5107822222222, 12.9161022222222, 15.53854
), XGBoost_XGBoost = c(8.42767715454102, 8.02925300598145, 7.27468395233154, 
12.2474374771118, 13.0366401672363, 13.088475227356, 12.264874458313, 
8.62850284576416, 10.4450559616089), XGBoost_SVM = c(13.0668720920662, 
11.9439605396003, 12.2892781235256, 18.9685052474489, 22.1775370825045, 
18.5729878124879, 18.412140924591, 13.7120185862238, 15.2216196143028
), XGBoost_RF = c(12.5330444444444, 12.6012, 10.6674022222222, 
17.7389044444445, 20.4518844444445, 18.4774088888889, 17.0711288888889, 
12.8564933333333, 14.4656444444444)), row.names = c(NA, -9L), class = c("tbl_df", 
"tbl", "data.frame"))

используя код ниже: 

taylor.diagram(Actual,
               Boruta_XGBoost,
               add=FALSE,
               col="#FFFF33", #the color for the points displayed.
               pch=19, #the type of point to display.
               #For Color: ("#FFFFFF" = White, “#990000” = Red) see more:- http://www.cookbook-r.com/Graphs/Colors_(ggplot2)/

               pos.cor=TRUE,
               xlab="Standard deviation (Normalized)", 
               ylab="Standard deviation (Normalized)", 
               main="Taylor Diagram of all applied models Vs Actual",

               show.gamma=TRUE, #whether to display standard deviation arcs around the reference point (only for pos.cor=TRUE).
               ngamma=4, #the number of gammas to display (default=3).
               gamma.col = "red", #color to use for the gamma arcs (only with pos.cor=TRUE).

               sd.arcs=3, #whether to display arcs along the standard deviation axes.
               ref.sd=TRUE, #whether to display the arc representing the reference standard deviation.
               sd.method=TRUE, #Whether to use the sample or estimated population SD.
               grad.corr.lines = c(0.2,0.4,0.6,0.8,0.9), #the values for the radial lines for correlation values

               pcex=2.8, cex.axis=1.8, cex.lab=2.2, #pcex for size of 'pch'; cex.axis for size of tick; 
               normalize=TRUE, #whether to normalize the models so that the reference has a standard deviation of 1.
               mar=c(5,6,5,10), #margin=( bottom, left, top, right); only apply for pos.cor = TRUE plot

               lwd=10,
               font=6,
               lty=1)

Мои карьеры:

  1. почему размер оси x -label не увеличивается ?, однако я также использовал cex.sub аргумент.
  2. как увеличить размер гаммы и sd.ar c строки?
  3. как изменить цвет строки sd.ar c?
  4. как сохранить этот график в редактируемый файл ?; однако я использовал library(officer), но не тренировался
  5. Разве у нас нет ggplot2 для того же? если да, то поделитесь, пожалуйста,
  6. Любой единичный ответ на единственный вопрос также приветствуется. большое спасибо!

1 Ответ

1 голос
/ 06 мая 2020

Это частичный ответ. Ответы по номеру карьера в вопросе:

  1. Ваш код cex.lab=2.2 работает. Я поменял его на cex.lab=1 и получил очень заметные отличия. То же самое и для других опций cex.

2 - 3. Это не опции в функции. Однако вы можете скопировать код функции отсюда: https://github.com/plotrix/plotrix/blob/master/R/taylor.diagram.R и изменить то, что вы хотите, сохранить его как свою собственную функцию. Например, в сегменте с пометкой «# добавить оси» измените параметр цвета на col = "red" или на другой.

Я не знаю, что вы имеете в виду под редактируемым сюжетом. Может быть, кто-то еще может обратиться.

Поиск https://ggplot2.tidyverse.org/reference/index.html не дает ничего, соответствующего «taylor», поэтому я так не думаю.

...