R раскрыть компанины - PullRequest
0 голосов
/ 27 мая 2020

Я использую библиотеку R GenomicDataCommons для получения некоторых столбцов данных из API.

Вот то, что я пробовал,

ge_manifest = files() %>%
    filter( cases.project.project_id == 'TCGA-BRCA' & cases.samples.sample_type=='Solid Tissue Normal') %>% 
    filter( type == 'gene_expression' ) %>%
    filter( analysis.workflow_type == 'HTSeq - Counts') %>% 
    expand('cases.samples') %>% results_all() %>% 
    as_tibble()

И это выдает сообщение об ошибке как показано ниже,

Error in UseMethod("expand_") : 
  no applicable method for 'expand_' applied to an object of class "c('gdc_files', 'GDCQuery', 'list')"

Мы очень ценим любые предложения или поддержку. Спасибо!

...