Я использую библиотеку R GenomicDataCommons
для получения некоторых столбцов данных из API.
Вот то, что я пробовал,
ge_manifest = files() %>%
filter( cases.project.project_id == 'TCGA-BRCA' & cases.samples.sample_type=='Solid Tissue Normal') %>%
filter( type == 'gene_expression' ) %>%
filter( analysis.workflow_type == 'HTSeq - Counts') %>%
expand('cases.samples') %>% results_all() %>%
as_tibble()
И это выдает сообщение об ошибке как показано ниже,
Error in UseMethod("expand_") :
no applicable method for 'expand_' applied to an object of class "c('gdc_files', 'GDCQuery', 'list')"
Мы очень ценим любые предложения или поддержку. Спасибо!