Я пытаюсь найти способ нанести координаты электрода ЭЭГ на трехмерное изображение мозга мыши, подобное этому:
Извините, есть много картинки, показывающие, что было сделано. Я немного новичок в python, поэтому я все еще пытаюсь выяснить, какая информация является наиболее важной, чем нужно поделиться. Пожалуйста, не стесняйтесь спрашивать дополнительную информацию о том, что я сделал.
Вот что было сделано на данный момент в блокноте Jupyter:
import os
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.gridspec import GridSpec
from allensdk.core.mouse_connectivity_cache import MouseConnectivityCache
%matplotlib notebook
Вот как мы взаимодействуем с координаты электродов на ЭЭГ:
coords = pd.DataFrame({'AP': channel_AP, 'ML': channel_ML})
coords.head()
Фотографии, показывающие больше того, что было сделано:
Это код того, как я приблизительно идентифицирую, в какой области мозга мои электроды закончились: