Есть ли способ нанести электроды ЭЭГ на модель мозга мыши? - PullRequest
0 голосов
/ 06 мая 2020

Я пытаюсь найти способ нанести координаты электрода ЭЭГ на трехмерное изображение мозга мыши, подобное этому:

3D Human Brain with EEG electrode positions shown

Извините, есть много картинки, показывающие, что было сделано. Я немного новичок в python, поэтому я все еще пытаюсь выяснить, какая информация является наиболее важной, чем нужно поделиться. Пожалуйста, не стесняйтесь спрашивать дополнительную информацию о том, что я сделал.

Вот что было сделано на данный момент в блокноте Jupyter:

import os
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.gridspec import GridSpec
from allensdk.core.mouse_connectivity_cache import MouseConnectivityCache
%matplotlib notebook

Вот как мы взаимодействуем с координаты электродов на ЭЭГ:

coords = pd.DataFrame({'AP': channel_AP, 'ML': channel_ML})
coords.head()

Фотографии, показывающие больше того, что было сделано: Mouse Brain Template Mouse Brain Template cont.

Это код того, как я приблизительно идентифицирую, в какой области мозга мои электроды закончились:

This is the code for how I am IDing approximately what brain region my electrodes are over

...