DESeq2: Получение результатов множественных сравнений - PullRequest
0 голосов
/ 11 июля 2020

Я следую экспериментальной схеме DESeq2, и мне интересно, как получить результаты для всех парных сравнений.

Дизайн

Genotype Days WT 50 WT 100 WT 200 A 50 A 100 A 200 B 50 B 100 B 200

По умолчанию resultsnames являются Intercept Genotype_A_vs_WT Genotype_B_vs_WT Days_100_vs_50 Days_200_vs_50 GenotypeA.Days100 GenotypeB.Days100 GenotypeA.Days200 GenotypeB.Days200

Как получить результаты для 1. WT.50 vs A.50, WT.50 vs B.50, A.50 vs B.50 и аналогичные сравнения за 100 и 200 дней? 2. WT.50 vs WT.100, WT.56 vs WT.100, WT.100 vs WT.200 и аналогичные результаты для генотипов A и B?

...