Как l oop над двумя текстовыми файлами с помощью wget и добавить вывод в файл? - PullRequest
0 голосов
/ 19 июня 2020

У меня есть два файла (в каждом по 300 строк), например:

head 1g.txt
rs6792369
rs1414517
rs16857712
rs16857703
rs12239392
...

head 1n.txt
rs1042779
rs2360630
rs10753597
rs7549096
rs2343491
...

Я могу запустить команду wget вручную для каждой пары rs # из каждого списка следующим образом:

wget -q --header='Content-type:application/json' 'http://rest.ensembl.org/ld/human/pairwise/rs6792369/rs1042779?population_name=1000GENOMES:phase_3:KHV'  -O - > list.txt

я бы хотел выполнить эту команду для каждого SNP в одном списке (1g.txt) для каждого SNP в другом списке (1n.txt)

, чтобы это выглядело так, где SNP # является rs # и выводит каждую строку результата в list.txt

enter image description here

...