Когда вы говорите мобильное приложение, вы говорите о JME или Android? Единственные телефоны JME, о которых мне известно, что поддержка 3d - это мобильные телефоны Siemens, и я думаю, что у них есть какой-то собственный API для них. Я полагаю, что у Android есть свои собственные привязки для OpenGL-ES, которые могут снять требование о включении Jogl (привязка Java для OpenGL).