Итерируйте окна, которые могут перекрывать ваши, многократно вызывая GetWindow (), используя GW_HWNDPREV. Используйте GetWindowRect (), чтобы проверить, действительно ли такое окно перекрывает ваше. Для двух известных окон нет ярлыков, просто проверьте, возвращает ли GetWindow () hWnd2 во время итерации.