Ваша версия VS действительно старая, не уверен, применимо ли это.Но в VS2005 / 8 вам пришлось бы запретить наследование настроек из таблицы свойств проекта «Базовая библиотека Windows».Что бы вы сделали, либо удалив лист из проекта, либо установив для параметра Linker + Input значение:
$(noinherit) kernel32.lib user32.lib
и так далее, перечислив все реально используемые вами библиотеки.