Нельзя напрямую преобразовать базу данных SQL Compact в полную базу данных SQL Server 2008, поскольку они имеют совершенно разную структуру.
И, насколько мне известно, вы не можете использовать SSIS (службы интеграции SQL Server) для копирования данных из базы данных SQL Compact в базу данных SQL Server (возможен другой способ).
Таким образом, единственный реальный вариант - написать приложение, которое считывает данные из базы данных SQL Compact и затем вставляет их в SQL Server.